有民眾表示豬肉儀表板美豬進口數量疑與「邊境查驗自動化管理系統」進口資料不符，對此食藥署表示，邊境查驗和豬肉儀表板的系統不同，但未來會儘速完成系統更新資訊公開一致，而食藥署也進一步指出，針對肉品進口有3個嚴格把關流程：報關、食安與動疫病檢測，完成這3個步驟肉品才正式進入市面。

食藥署公關郭旭棋受訪時指出，國內針對肉品進口有3個嚴格把關流程：

1 先至關稅署申請報關：輸入肉品要先至關務署申請報關。

2 食品安全衛生檢測：關務署依據肉品產品特質分給食藥署及防檢局，由食藥署針對食品安全衛生檢測。

3 動物疫病檢測：防檢局會針對動物疫病做檢測。

郭旭棋表示，食藥署與防檢局雙兩方檢測無誤後，才會開出相關證明，業者取得證明後到關務署做最終檢核，由關務署檢核無誤後會放行，才會到市面。

自1/4日起「豬肉儀表板」每日更新台灣豬肉與豬肝、豬腎、豬其他可食部位的數量，以及進口豬肉與豬肝、豬腎、豬其他可食部位，還有這些豬肉所檢驗出來萊劑的批數與重量，但「邊境查驗自動化系統」只是食藥署在邊境查驗合格的數量，而豬肉儀表板則是食藥署、農委會和關務署匯整統計後顯示的進口資料。因為各部會系統、匯整資訊的方式不同，因此讓資訊產生時間差。食藥署表示，將會逐步調整，儘快把資訊同步。

從今年1月1日至1月8日，衛福部食藥署的「豬肉儀表板」顯示進口豬肉來自加拿大、丹麥、美國，進口豬肉約308噸，占3%；以丹麥豬最多，其次為加拿大豬，第3名為美豬，無任一國進口豬檢出萊劑。