對於憲兵搜索民宅爭議，總統馬英九8日出席「和平與女性人權館」揭牌儀式時罕見接受媒體訪問，他說，這兩天密集與行政院長張善政通電話，確立處理原則「毋枉毋縱，深入調查，發現真相，加以處置。」

馬英九強調，憲兵是優秀的軍種，也具有司法警察的身分，這是刑事訴訟法規定，「但是在這案件，進入民宅調查民眾，顯然有過當之處。」

馬英九說，政府一方面要調查真相，另一方面，他也呼籲民眾冷靜看待這件事，「確實有少數軍人犯了錯，但是也不要一竿子打翻一船人。」他說，要根據比例原則負起責任，認錯改錯、接受懲處。

馬英九強調，大家想想看，每到災難發生時，國軍都在第一時間無怨無悔、不眠不休地投入救災，希望大家從這角度，不要一竿子打翻一船人。他強調，政府會非常嚴肅面對此案，一定會對民眾做清楚交代。