總統馬英九15日在府內召集總統府五長舉行震災相關會議，之後聽取行政院長張善政對災後重建進度報告，並和行政院、國安會等單位交換意見。府方人士轉述，會中，馬英九肯定張善政在南台灣震災的救災、重建或預防工作表現，並指示行政團隊持續和地方政府通力合作，讓災區早日回復正常。

馬英九表示，15日為年後上班第一天，總統府早晨降半旗並取消府內新春團拜活動等，以表示對罹難者的哀悼。對於此次由張善政領導的行政團隊，不管在救災、重建或預防工作上皆表現得迅速確實，馬英九表示肯定。

馬英九指示，行政團隊持續和地方政府通力合作，讓災區早日回復正常，並全面檢視國內建築物抗震補強的規劃，避免憾事再度發生。