針對憲兵搜索民宅爭議，行政院長張善政7日召開記者會坦言此舉「相當不妥」，並宣布將相關知情主管調離現職，靜候調查。稍後，總統府發言人陳以信表示，總統馬英九對於此事非常重視，是在上午指示張善政及相關單位認真檢討，儘速查明真相對外說明。

陳以信強調，中華民國是堅持民主與人權普世價值的國家，而政府存在的目的在於保障國民的人權，為人民打造自由生活的環境。但他也指出，在司法機關查明真相前，任何無端影射的政治操作，不僅於事無補，反而會對社會造成傷害。

此外，行政院發言人孫立群也向媒體表示， 張善政是在上午與馬英九的例行會議中，達成共識，必須儘速讓民間釋疑，所以決定開記者會對外說明。