有民眾反應，到餐廳點用腐皮等相關菜餚時，餐廳卻未揭露腐皮是否為基因改造食品，連鼎泰豐、六福客棧、京星等知名餐廳，在詢問之下才知道，店家大多仍使用基因改造黃豆。對此，食藥署20日強調，基改標示規定於12月31日實施，未來店家販售豆漿、豆花、腐皮、豆腐等相關製品時，都必須標明是基改食品。
豆類製品在台灣十分普及，不過，並非所有民眾都清楚得知，自己吃的究竟是否為基因改造食品。有民眾到鼎泰豐吃飯，一問之下才知道，自己吃的都是基改油豆腐。鼎泰豐則解釋，因國內找不到非基改黃豆，油豆腐細粉是委外製作，鼎泰豐7月才推出自行研發的非基改黃豆腐皮，成本也隨之提高。
而京星港式飲茶也指出，因國內買不到非基改黃豆，所以店內的腐皮捲是用基改黃豆製成；其他餐廳則抱怨，非基改黃豆不好買，且若使用非基改原料，成本也會隨之提高，「消費者能接受嗎？」
對此，食藥署表示，今年5月29日已預告「直接供應飲食場所之食品含基因改造食品原料標示規定」草案，規定具營業登記直接供應飲食場所之食品含基因改造食品原料者，應標示「基因改造」或「含基因改造」字樣，預定於12月31日實施，現正辦理法規公告的行政作業，未來餐廳若販售使用基因改造食品原料製成之豆漿、豆腐、豆花、豆乾、豆皮、大豆蛋白製得之素肉產品，皆須明確標示基因改造食品資訊。
食藥署重申，除了餐廳是從年底開始規範，現行辦法規定，不論是包裝食品、食品添加物或散裝食品，只要含有基因改造食品原料，應依規定期程標示；至於餐廳、小吃店等，未來販售之食品中含基因改造食品原料應依相關規定標示，如未依規定標示或有標示不實之情形，將依《食品安全衛生管理法》規定令業者限期改正，並處以3萬元至300萬元或4萬元至400萬元罰鍰。
