《商業周刊》的「牛奶駭人」報導引起外界爭議，經過多次對外說明，商周昨(27)日在向衛福部食藥署補交檢驗資料後，晚間在官網上發布聲明，對於報導造成社會紛擾感到抱歉。對此，食藥署副署長姜郁美今(28)日表示，媒體可以監督政府，但在發布檢驗報告時應用國家公告的檢驗法，並且需以嚴謹的態度面對。
商周的報導以檢驗代謝物的方法，質疑市售9款乳品使用動物用禁藥；而食藥署及農委會則以檢驗藥物殘留方式抽驗乳品，結果則是未檢出。由於商周公開檢驗結果時並未附上詳細報告，在食藥署的要求下，商周昨天以快遞方式在下午4點多時將資料補上，食藥署表示將不會開罰。
同時，商周也在晚間以「我們的反省與使命」為題，發布聲明表示，追求事實是媒體的使命，但這次報導的方式，可以再更全面。對於造成社會的紛擾，商業周刊表示並非初衷，「對此，我們深感抱歉」。
姜郁美今天上午指出，經過查看，報告應該暫無缺失，2天內會再請專家及銘傳大學副教授陳良宇一同出席專家會議，討論檢驗方法的可行性。不過，她也表示，商周一開始沒察覺到事態的嚴重性，不斷「硬拗」，才讓事件發酵至今。
姜郁美說，歡迎媒體監督政府，但是在公布資料時，也應確保資料的完整性及正確性。另外，她強調，最好以國家公告的檢驗方法為準，這樣判定方法才不會不一致。
對於商周的道歉聲明，中華民國酪農協會則說，周刊的聲明僅在網路上公布，也未對酪農特別致歉，因此不會將此作為正式的「道歉」。協會指出，27日已將律師信寄出，會再等待商周收到後7天內回應；至於協會的後續行動，目前則還在研議當中。
