日本核災造成部分日本生產的海鮮及農產品遭到輻射污染，而衛生署也將全面查驗日本進口海鮮，進口業者憂心假如全面封鎖日本製海鮮產品，將會「錯殺」只是在日本加工，其實是在日本境外養殖的漁獲。
衛生署日前指出，即日起將不分地區，只要是日本相關海鮮產品輸至台灣，一定百分之百全面抽驗，每批都會檢驗，不讓受到輻射污染的食品進入台灣。如果日本食品、水產品的檢測輻射值超過我國「食品中原子塵或放射能污染安全容許量標準」，即一律不得輸入。衛生署將派員監控，由業者在海關邊境銷毀。
輸出入相關同業公會聯誼會召集人張哲輔在今（23）日舉行的「廠商拓銷全球市場成果發表會」中指出，日本對海鮮的需求量大，擁有全世界最大的海鮮收購體系，大型水產商在全世界都有分公司，挑選全球最頂級的海鮮再送回日本加工。日本擁有全世界最精良的海鮮加工處理技術，再加上海鮮的種類又多，國內海鮮進口商多半選擇和日本的海鮮大廠合作。
許多專門經營台日貿易廠商的與會者都對台日貿易感到十分憂心。業者舉例說，日本帝王蟹很多都來自俄羅斯，另外，大龍蝦、貝類、鰻魚、石斑、蝦子及高檔魚貨，大部份都來自台灣人在海外養殖場，日本人大量收購後，再運回日本加工。
日本核災的確造成許多消費者不敢食用日本貨，許多海產業者已由其他產地的漁獲取代。但生魚片價格可沒因此上漲，南部業者表示，屏東等地銷往日本的鮪魚、旗魚等魚貨，傳出因日本海、空卸貨不便，業者將轉內銷，使得國內的貨源更充裕，造成生魚片市場行情微跌。而且漁獲超低溫冷藏庫存可調節市場供貨的穩定，短期內漁獲行情受震災影響不大。
