台灣社社長張葉森、台灣北社社長李川信等獨派團體今（8）天下午召開記者會，指出台北市長柯文哲2002年6月的博士論文22至23頁中所處置的「無心跳器捐者的維持」，違反學術、醫學倫理，以及有加工死亡」嫌疑，要求教育部調查並撤銷柯文哲博士論文與資格。對此，教育部表示，將先交由台大進行事實釐清並決定是否受理此案。
台灣社社長張葉森下午偕同台灣北社社長李川信、台灣教師聯盟理事長蕭曉玲、台灣關懷中國人權聯盟理事長楊憲宏、作家馮光遠等人前往教育部陳情，並遞上檢舉函給教育部。
蕭曉玲表示，要求教育部，站在維護學術尊嚴及醫學倫理基礎，調查並撤銷柯文哲博士資格，因柯的博士論文，與獲得此一學位的前後，涉及多起不當及不法行為。
楊憲宏指出，柯文哲2002年6月發布的博士論文，其中22至23頁中所處置的「無心跳器捐者的維持」，病人在未腦死，心跳也仍然存在時，被靜脈注射藥劑，其目的在，讓「病人心跳停止後，錄下心電圖，取得心跳停止之書面證明」。其「加工死亡」過程令人髪指。
楊憲宏接著說，另一個「加工死亡」的證據是在葉克膜（ECMO）灌流過程，從股動脈「插入阻塞氣球導管」，「打入34.5c.c空氣以膨脹氣球，阻斷胸主動脈」，目的在阻止灌流液進入心臟，阻止心跳重現。他加重語氣地說，「這會痛嗎？會！但當事人叫不出來」。
對此，高等教育司專門委員王淑娟回應，依據學術倫理案件處理原則，教育部收到案件後，會進一步了解狀況，待確定受理後，會循程序處理，且視個案複雜程度不一，原則上要耗費4到6個月才能做出裁定。
王淑娟說，現在先請台大召集專業群釐清事實，確認是否符合要件並受理，再進入實質調查與審查，並做出專業判斷，並再提請教評會（涉及老師）與論文審議委員會（涉及學生）等有權責單位，針對調查結果決定論文是否要做後續處理與撤銷。
