太陽花學運、林義雄反核禁食等抗爭行動相繼登場，一開始都因為抗爭立場堅定，執政黨又不肯退讓，讓抗爭行動看似無法在短期內落幕，許多人更擔心最後會以流血衝突或悲劇收場，但最後分別因為王金平對服貿審議的承諾和執政黨對核四立場的讓步，突然浮現退場機制，讓抗爭行動順利落幕。這樣的演變，也讓許多台南市民不禁要問：抗爭長達二年的台南鐵路地下化爭議，何時才會出現退場機制，結束這場看似零和的公權力和人民居住權的對立？
任何抗爭行動的立場都是鮮明而堅定的，二０一二年八月反南鐵東移自救會成立後，即表明不反對鐵路地下化，但堅決反對在尚有其他方案的情況下逕行徵收民地，採用鐵路東移的做法，自救會曾建議潛盾工法，抗爭無效後，最後防線為房地出借做為臨時軌，待鐵路地下化工程完工後再歸還居民。但因台南市政府堅稱鐵路東側施工是最佳方案，雙方毫無交集，加上雙方對環評、工法、法律都有歧見，自救會另要求舉辦具有法律效力的聽證會，廣徵各界意見凝聚共識。至此，「停止都市變更」、「原軌施作不東移」及「辦聽證解爭議」，成為自救會的最終立場。
但台南市政府認為經過各方研議，並沒有其他工法比鐵工局規畫的鐵路東側施工更好，市府沒有立場反對；至於聽證會，市府認為目前並無法源依據，並以內政部將研議土徵條例納入聽證程序，顯示現行土徵程序並無聽證會規定，才需要修法，市府即便承諾舉辦聽證會，也不具法律效力。台南市長賴清德更在三月六日重申：「這是我的責任，更是不悔的目標」，做了才能讓台南市脫胎換骨。」「本案沒有替代方案，除非不做。」
由於雙方迄無任何交集，自救會的抗爭行動將難以中止，自救會除每週定期開會，並邀學者和社運團體參與，只要有任何和南鐵地下化有關的行程，都會緊急聯絡居民放下手邊工作，趕到現場抗爭。自救會控告環保署環評違法的案件五月十二日將在高等法院審議，自救會也將集體北上表達立場。
台南市政府除了依序完成都市計畫審議的必要程序，包括日前接連兩次引爆衝突的都市計畫公展說明會，完成都市計畫送交內政部都委會審議，以利鐵路地下化工程的進行外，為了化解爭議，市府自去年十月起以「鴨子划水」的方式，由賴清德率相關首長利用下班時間逐戶拜訪居民。
原經套圖概估之四百零七戶預估拆遷戶數，經逐戶現地確認後已降為三百廿三戶，其中十七戶失聯，已拜訪九成多的居民。市府也利用這個機會，即時處理所反應之各項問題。包括就醫需求、委請市府協助申辦其他相關補助費用、工作安排協助、生活照顧服務、低收資格之保障等。市府秘書處長蕭博仁還強調：「公部門能做的，市政府都做了，就連公部門不能做的，我們也都想儘辦法幫居民解決，還不能公開講。」顯示市府官員也有其無奈和委曲。
對於徵收的私有土地，市府也表明除了給予依市價查估的現金補償，考慮被拆遷戶的實際需求，在都市計畫審查過程中也會提出容積補償、建蔽補償、簡易都更和道路截角調整等措施，儘可能減少拆遷戶的損失。此外，市府為了照顧拆遷戶的居住問題，首開先例，特別專案辦理照顧住宅，在今年三月七日與得標廠商富立建設簽約興建高品質的照顧住宅，預估以每坪大約十萬五千元的超低售價優先提供拆遷戶購買，條件優惠。
市府一方面致力於各項補償方案，一方面也不斷對外宣傳鐵路地下化對台南市發展的重要性，企圖營造更大的社會壓力給拆遷戶，雖然確實帶給拆遷戶極大的壓力，一些經常在媒體上露臉的自救會成員還曾經多次在外被其他市民指責妨礙都市發展，但這樣的情況，不僅未使自救會幹部知難而退，反而更加堅定其抗爭信念，因為他們深信在積極實踐民主和人權的台灣，雖然少數應該尊重多數，卻也不應以多數暴力踐踏少數人的基本人權，在還有其他方案的情況下，不應把鐵路東移當成唯一方案。「不必要的土地徵收，無異於違反憲法保障之財產所有權與居住權。」
值得觀察的是，台南市政府和反南鐵東移自救會始終各據立場，未來恐將難以避免後續的衝突，一旦被拆遷戶發生不必要的意外，一旦形象溫和、又屬民進黨籍的賴清德在迫不得已時動用警察處理群眾抗爭事件，勢必被外界放大檢視，並對照國民黨執政的中央政府和台北市政府處理反服貿、反核鎮壓模式，引發更大的爭議，也將為賴清德的總統之路徒增變數。
國民黨人士似乎也注意到了這個現象，過去因為怕得罪多數支持鐵路地下化市民的藍營市議員，近來也相繼發聲力挺自救會，似乎也在為未來批判賴清德儲蓄「相罵本」。不過，這個現象十分吊詭，明明是國民黨執政的中央政府執行之鐵路地下化工程，卻讓協辦都市計畫等配合事項的台南市政府「公親變事主」，最後還引來國民黨台南市黨部主委謝龍介等人的批評，直嗆賴清德不能獨裁蠻幹到底！
由此看來，南鐵地下化爭議不僅在短期內無法弭平，一時之間也看不到南鐵地下化退場機制的任何曙光，還可能引發更多值得觀察的政治和社會變化，未來要如何化解爭議，端視何時才能浮現一個雙方都能妥協接受的退場機制，更要看賴清德如何以更高的政治高度和政治智慧來化解眼下的問題。
