對於未來與台北市長柯文哲關係，民進黨主席候選人、行政院秘書長卓榮泰今（19）日接受電台主持人周玉蔻訪問時表示，柯是可以進一步交往的朋友，但要在共同的中心思想上；他也認為，柯文哲不適宜再講兩岸一家親了。
華盛頓郵報18日刊登專欄作家 Josh Rogin文章，認為中國希望以比較容易控制的人來換掉蔡英文；但沒有提到誰是比較容易控制的人。不過，周玉蔻訪問卓榮泰時，則直接說華郵認為，中國想要用柯文哲來換掉蔡英文。對此，卓榮泰則說，能不能換掉誰，不是外國報紙或外國人所能講，而是台灣人民所講。
對於與柯文哲關係，卓榮泰說，他就是台灣台北的首都市長。黨與他的關係就是「可以再進一步交往的朋友，但是要在共同的中心思想與核心思想上」。
至於「兩岸一家親」說法，卓榮泰說，柯文哲應該有所調整了吧，柯後來不太講這個事情。他認為不適宜在講，因為兩岸一家親後面接的是「共圓中國夢」。兩岸可以彼此親來親去都沒關係，就是不要一家親。
會後，卓榮泰受訪指，柯文哲當選後應該專心於他的市政工作。他樂於看到柯文哲進行兩岸的城市交流，但其餘的事情，中央應該有中央的政策，希望大家能共同遵守、執行。他還說，如果去請教柯文哲，柯也會否認有所謂「柯家軍」。
至於與時代力量關係，未來選舉要不要合作，卓榮泰說，「如果我們有優秀的人選，應該以我們的人優先；如果我們在地方上，贏的策略不夠，尋求包括時代力量、其他友黨」，（所以你還是會禮讓黃國昌），「那不一定，我們如果有優秀候選人，我們以我們黨員為優先」。
