2019年公布修正的《工廠管理輔導法》，採取全面納管和就地合法的原則，不過反而讓農地違章工廠有機會納管成為合法工廠。綠色公民行動聯盟就發出三點問題，質疑工輔法，並呼籲經濟部應制定一套合理且有效遏止污染的農地工廠退場機制。
工輔法的制定，目的是為了促進工業發展，健全工廠管理及輔導。而為了避免違章工廠失控增長，立法院並在2010年6月2日增修《工輔法》第 33、34 條，明訂輔導違章工廠的主管機關是經濟部中部辦公室，輔導的對象是2008年3月14日前，已經存在的「低污染」違章工廠，可以透過「申請臨時工廠登記」，向地方政府申請搬遷到合法的特定地區，或進入工業區。
不過卻讓農地違章工廠反而有機會納管成為合法工廠，環團指出第一點問題，農地工廠排放污染，危害環境也影響食安，相較於工業區的工廠，農地工廠被特許用較低的成本在農地上運作，一旦排放污染，對環境、食安造成的危害更大。
第二點，環團則表示，「合法納管後，污染不減反增」，依照現行法規，偷排有毒廢水的工廠，都可以拿到工廠登記證就地合法，不只對守法的企業不公平，也不會對工廠管理產生嚇阻作用。最重要的是，政府沒有制定符合公平正義且有效遏止污染的退場機制，以致於《工輔法》正式生效後，隨著納管數量增加，污染違規的數量也增加三倍，甚至有業者在臨登階段就已開始偷排，取得特登後仍持續偷排。
最後環團指出，過去跟經濟部在協調會上溝通時表示，根據《工輔法》第25條，只要環保單位做出「勒令歇業」處分，就會撤銷工廠登記證，但實務上，環保單位幾乎不會做出「勒令歇業」處分，就算偷排有毒廢水，頂多是「勒令停工」，只要改善就可以復工。環團強調，把農地安全、糧食安全放在優先順序，盡快制定一套合理且有效遏止污染的農地工廠退場機制。
農地汙染違規筆數。綠色公民行動聯盟發出三點問題，質疑工輔法，並呼籲經濟部應制定一套合理且有效遏止污染的農地工廠退場機制。 圖：翻攝自綠色公民行動聯盟臉書
