武漢肺炎疫情持續延燒，關於病毒起源至今還是沒有定論。英國《星期日泰晤士報》調查稱中國科學家早在2013年已在雲南一個礦場上發現與武漢肺炎病毒相吻合的病毒株，武漢肺炎病毒研究所卻沒有將此事公開。

根據《星期日泰晤士報》報導，2012年夏天，6名礦工在雲南一座廢棄銅礦清理蝙蝠糞便時，出現發燒、咳嗽、呼吸困難等症狀，其中4人驗出有冠狀病毒抗體，3人死於肺炎。隨後，武漢病毒研究所的石正麗率領一組科學家調查了發生疫情的礦洞。科學家們在蝙蝠的糞便中發現152個冠狀病毒的基因組序列，其中一個類似於新冠病毒（SARS-CoV-2）的「新毒株」，被命名為RaBtCov/4991。這個報告在2016年發布，報告名稱為《多個冠狀病毒在廢棄礦井的多個蝙蝠群落中共存》，報告指它是SARS的新病毒株。

報導指出，科學家分析洞中蝙蝠糞便樣本進行分析，發現新冠病毒株與肺炎病毒96%吻合，卻沒有進一步研究。而後來發表的一項研究沒有提及受感染的礦工和由該病造成的死亡。石正麗本人在接受《科學美國人》雜誌採訪時說，她認為真菌性病害是導致礦工死亡的原因。而病毒樣本儲藏在武漢病毒研究所的實驗室。據傳團隊今年初想再分析病毒樣本時，發現樣本已經分解。

對此，武漢病毒研究所上周拒絕評論是否曾經隱瞞有關礦工感染病毒的資料。而美國總統川普5月聲稱「看過證據」，指武武漢肺炎病毒是來自武漢病毒研究所實驗室，中國方面則一概否認。而世界衞生組織上周表示，本周派出專家小組前往中國調查武漢肺炎病毒源頭。