監察院今(9)日通過糾正行政院及交通部，指出台灣鐵路管理局的組織定位矛盾又不明確、公司化政策及再生計畫遲遲未定案，且自94年起，每年皆虧損百億元以上，營運狀況不佳且負債持續增加，還出現了人事費用偏高、員工生產力低落的情形，問題層出不窮台鐵卻沒訂定出有效的方案改善，因此提出糾正。
監察院台鐵虧損案調查委員劉玉山、程仁宏、林鉅鋃、馬秀如、楊美鈴今日指出，台鐵的虧損情形由民國67年開始，在中山高全面通車時，首度出現虧損2.57億元的情況，而87年開始年虧損百億，至99年累計的虧損高達2,074億元。
監委表示，雖營運狀況不佳，台鐵過去幾年其實也有力圖改善，96年9月時，行政院秘書長主持了「台鐵提升效能專案小組」來改善負債問題，但在小組結束後，依然沒有成效，台鐵的虧損仍然持續擴大。
監委也指出，根據國營事業管理法第4條規定，國營事業應依照企業方式經營，以事業養事業，以事業發展事業，並力求有盈無虧，增加國庫收入。
監委稱，依照法條，台鐵局除了票價受政府管制、鐵路規畫、營運及管理均需配合政府政策外，應該還是要以企業「求盈餘而避免虧損」的方式經營。
監察院也認為，台鐵不但組織定位不明確、公司化政策與再生計畫遲遲未定案，且台鐵局的人事費用持續攀升，不但員工的勞動生產力低落，其中還有人力斷層、老化的情形發生，甚至也因為投資不足，出現以人力來取代資訊系統的情況發生，因此認為其中管理有所失當，提出糾正。
