「海峽兩岸智慧財產權保護合作協議」自去年(2010)6月完成簽署，國內赴大陸申請案件多為半導體、通訊、電子等高科技產業。另台灣農產品、影音著作權也開始獲得助益。
「海峽兩岸智慧財產權保護合作協議」自去年(2010)年9月生效，其成果如下：1.兩岸相互承認優先權，其中，以專利優先權最多。國內企業赴大陸申請案件，2010年共有22419件，商標10767件，其多半為半導體、通訊、電子等高科技產業。大陸企業來台申請專利案件則為755件，商標1603件。
依海峽兩岸智慧財產權保護合作協議，智慧局可協助案件處理，截至今(2011)年4/30日止，共有23家廠商，涉68件商標案件。其尋求協助的案件包括：台灣廠商的商標遭搶註，因而請求加速撤銷搶註商標，或在台已取得註冊商標，但到了中國申請時，因兩岸文化語言差異而被駁回。特別值得注意的，是加速審查的公益事由案件，如「台灣優良農產品CAS」、「台灣有機農產品CAS ORGANIC」證明標章，由於涉及農民利益而須加速審查，其已於今(2011)年1月起陸續獲准，取得商標權。
著作權認證部分，去(2010)年11月完成的財團法人台灣著作權保護協會(TACP)，協助台灣到大陸出版的影音製品取得認證，縮減以往須透過香港認證的耗時，可由台灣直接向大陸提出認證，僅需兩天，至今(2011)年3/31日止，TACP共接受錄音製品27件，影視製品5件，其中包括；〈羅志祥 獨一無二〉、〈丁噹 未來的情人〉、〈張惠妹 都什麼時候了〉、《第36個故事》等等。
台灣目前提出的植物品種權，其10個項目中，中國已將朵麗蝶蘭、文心蘭、印度棗、番石榴、芒果納入研究，另有台灣業者提出蝴蝶蘭申請案。
