流感疫情逐漸退燒，為此，多名立委7日在立法院衛環委員會砲轟衛福部未在第一時間成立疫情指揮中心，導致疫情掌握零零落落，才會造成大規模流行。衛福部長蔣丙煌上午受訪時雖然表示，對於流感疫情「不會有任何懲處」，不過，疾管署長郭旭崧則坦言自己沒有掌握疫情先機，已口頭向蔣丙煌自請處分。
據疾管署的監測資料顯示，國內流感併發重症通報在2月22日達到單日高峰105例，不過，在3月6日已經下降到14例，各醫學中心單日類流感就診人次也降到百名以下，顯示流感疫情趨緩。蔣丙煌上午受訪時則表示，經過分析，B型流感疫情有上升趨勢，未來又有寒流來襲，衛福部會嚴密監控，在必要時採取適當措施。不過，他也強調，B型流感引發的病情會較A型流感輕微，民眾不需過於恐慌。
至於日前流感疫情大爆發，是否會有懲處名單？蔣丙煌則強調「不會懲處」。
不過，民進黨立委劉建國質詢時質疑，流感疫情從去年就已經開始，併發重症死亡案例更達84人，疾管署卻未在第一時間具體建議衛福部成立疫情指揮中心。時代力量立委洪慈庸也質疑，這次流感疫情是2009年以來最嚴重的，但衛福部橫向溝通出現問題、疫情掌握不佳，她批評，520前雖是看守內閣，但不能是「冬眠內閣」。
對此，郭旭崧坦承，疾管署沒掌握疫情先機，導致衛福部其他單位措手不及，他本人責無旁貸，已向部長口頭道歉並自請處分。
不過，郭旭崧也說，季節性流感疫情與SARS等不同，不確定性較高，因此只成立應變小組，若成立中央指揮中心，會多出許多行政流程，讓防疫腳步更凌亂。
