法務部長邱太三在答覆立委書面質詢時，公開宣示將廢止特偵組。邱太三11日在行政院會後記者會中表示，2006年設立特偵組時，立委們對於打擊貪腐有很多「美麗的期待」，但因為倉促立法，導致事後與想像出現很大落差。未來特偵組廢除後，特權貪腐案件將回歸地檢署來偵辦，他也希望各界不要忽視地檢署的辦案能量。
邱太三強調，特偵組的辦案能量、人力先天不足，因此，很多檢察官、事務官的人力都是從地檢署、高檢署徵調而來，分散了這些組織的辦案能量。因此他相信回歸地檢署偵辦，對於打貪的決心和效果不會有任何減損。
對於外界擔心，回歸地檢署是否沒有能力處理高階官員的弊案？邱太三說，過去地檢署也曾辦過部長、廳長級的相關案件，因此，他對地檢署檢察官、事務官的能力非常有信心。
邱太三指出，廢除特偵組主要是因為在法制面上有2點必須檢討。首先，特偵組設立在最高檢察署，導致刑事訴訟法中「分工與監督」的設計受到混亂。因為地檢署受高檢署監督、高檢署受最高檢監督，但若案子一開始就由最高檢下的特偵組來偵辦，將面臨無人可監督的窘境。
此外，在刑事訴訟制度上，有所謂「再議」的救濟制度，但因特偵組屬最高層級，若因此獲判不起訴或緩起訴，將與刑事訴訟法中的「再議」制度相抵觸，沒有任何救濟制度可以保障被告權益。
邱太三也說，廉政署於2011年成立，當年的時空背景認為增加機關對於肅貪是好事，卻讓彼此的辦案出現衝突，形成「三個和尚沒水喝」的窘境。部分地檢署原本在辦的案件，被最高檢「拿去」，也讓內部出現不少怨言，因此裁撤特偵組，將有助於減少內部矛盾。
