立法院臨時會院會25日針對《政黨及其附隨組織不當取得財產處理條例》展開逐條表決大戰，第2條「主管機關」在民進黨立委多數優勢下，以72票對31票表決通過，未來行政院將下設不當黨產處理委員會，進行不當黨產相關調查。

在《政黨及其附隨組織不當取得財產處理條例》（簡稱不當黨產條例）主管機關部分，國民黨立委楊鎮浯在登記發言時表示，將調查權、處分權、裁罰權都歸於行政權底下，將暴露在極大風險和不公不義之中。國民黨立委廖國棟也認為，不當黨產條例若由行政院主管，會有違憲法權力分立的原則，很可能是「東廠再現、警總復辟」，應設置在監察院，避免調查權濫用。

民進黨立委葉宜津則表示，國民黨黨產是當年黨國不分的產物，不當黨產是要還給國家，不是某個政黨，因此主管機構設置在行政院是合理的一件事。「不要因為國民黨可以實質掌控監察院，就要這個法條到監察院去。」

時代力量立委黃國昌也強調，針對主管機關的歸屬，在委員會就已經一而再再而三的討論，若依照民進黨版由行政院主管，受到處分就是行政處分，若不服，可以送行政法院進行救濟。若是由國民黨所主張的監察院主管，馬政府時期的內政部長陳威仁在報告中就曾提到，「後續要如何展開司法救濟，會有很大的疑問。」

而在隨後的表決當中，民進黨仍以席次優勢，以72票贊成，對31票反對，通過民進黨黨團提出的第二條修正動議，未來行政院將下設不當黨產處理委員會，進行不當黨產的調查、處分。目前院會仍針對不當黨產條例，進行逐條表決中。