司法院長賴浩敏及副院長蘇永欽11日分別以「個人生涯規劃」、「讓總統有更大的用人空間」為由請辭。對此，蘇永欽12日公開日前寫給總統蔡英文的辭職信，指蔡英文在就職演說中強調新政府將積極推動司法改革、召開司法國是會議，但蘇永欽則說「憲法並沒有直接賦予總統改革司法的職權」，並批評立法院民進黨團總召柯建銘不諱言民進黨團不願司法改革成為前總統馬英九的政績，才讓相關法案在立法院停擺3年半之久。
蘇永欽在這封寫於2016年5月24日的信中提到，蔡英文在520就職演說中，已明確表達對於司法問題的關注，強調「司法無法親近人民，不被人民信任，司法無法有效打擊犯罪，以及司法失去作為正義最後一道防線的功能，是人民普遍的感受。」因此「新政府也會積極推動司法改革」，「為了展謝新政府的決心，我們會在今年10月召開司法國是會議，透過人民實際的參與，讓社會力進來，一起推動司法改革，司法必須回應人民的需求，不再只是法律人的司法，而是全民的司法。」
蘇永欽直指，「您面對的困難是，憲法並沒有直接賦予總統司法改革的職權。」透過政黨政治的平台（釋字520號解釋）總統可以實際影響的範圍，恐怕也僅限於有效打擊犯罪，不及於司法院職權所在的其他部分，因為依憲法分權的明確意旨，「司法院並不是新政府的一部分」。
蘇永欽也說，蔡英文可以落實這部分民意的唯一途徑，就是提名改革理念與其接近者為司法院長、副院長，這也是憲法增修條文第5條第2項的意旨所在。基於這一層的考量，他願意辭去大法官及司法院副院長的職務。
蘇永欽也表示，自己必須辭職的另一個原因，是報載未來將在總統府設置司改委員會，以免重蹈過去院部間相互掣肘的老問題。蘇永欽認為，這可能會過度解讀了憲法第44條院際爭執會商解決機制，侵越了司法院的職權。蘇永欽表示，自己在司法院任職已將近6年，對於院部在司法政策上常有大大小小的爭議，十分了然。
蘇永欽表示，以上應已明確表達辭職的理由，「既不是負責，也不是單純基於禮貌。」對於蔡英文在演說中提到全民司改的想法，他表示深有同感。蘇永欽指出，他在18年前寫的「司法改革的再改革」就有這樣的主張，6年前在立法院的同意程序中，也明確宣示了同樣的「司法社會化」理念：「從人民的角度看問題，用科學的方法解決問題」，也說賴浩敏院長在就任後立刻啟動「全民司改列車」，和蔡英文的司法國是會議相去不遠。
蘇永欽說，過去5年司法院的改革重心一直放在縮短社會與司法的距離，提高人民對司法的認識與認同上，「推動人民參與審判只是多項社會化政策中的一項，絕對不是全部。」到目前為止，不能說已有很顯著的效果，但確實有一定的進展。
蘇永欽指出，司法院在2012年6月提出草案到立法院之前，就做了很多調查，提出後，更立即著手推動模擬審判，已在10所法院進行50場，對於此一全然陌生的制度可能碰到的問題及改善之道，已累積了非常豐富的紀錄與心得，也對人民參與審判的可行性有更大的把握。
接著他話鋒一轉，「非常遺憾的是，司改法案在立法院擺了3年半，還是沒有通過，政策理念的不同恐怕不是最主要的原因。」並指「民進黨團不願看到這個改革和馬英九的政績一起被評價，這才是真正的原因」，且柯建銘從未諱言此說法。
蘇永欽表示，希望在蔡英文的領導下，這種對立的民主思維可以真正走入歷史。正因為不同意在總統府設置司法改革委員會以及召開司法國是會議的做法，自己續任副院長一職並不妥當，請蔡英文盡快在人事上做決定。
最後，蘇永欽表示，誠摯祝禱蔡英文成功地為台灣打造一個不被意識形態綁架的團結民主，也祈願建立一個真正屬於人民的司法。
