為了追查大巨蛋文件外洩事件，北市政風處竟找上民間公司對市府3位顧問及機要進行測謊，其中，黃姓機要因不願測謊而選擇離職，引發議員抨擊是白色恐怖。對此，市長柯文哲15日重申，測謊是有當事人為自清所提，他還透露，黃姓機要絕非因此事離職，而是有其他事情，但並未明確說明。
針對測謊風波，柯文哲14日於議會備詢時坦承，有市府人員因不配合測謊而離職。不過，發言人林鶴明15日上午受訪則指稱，當事人表示有「個人考量」，柯文哲下午被問及此事時也說，「這個人去職，也不是因為這件事情（測謊），是有另外的事情」，但柯文哲一度脫口稱「他當然別無選擇啊，他幹那個...」隨即打住，並未多說。
柯文哲解釋，一般來講，市長都不會去干涉細節，政風處要如何處理，都讓他們自己去處理，此外，測謊也非政風處所要求，而是有當事人為了自清所提。對於外界批評是白色恐怖，柯文哲則說「沒那麼嚴重」，他強調，市府不會去搞白色恐怖，但內部有內部管控紀律，不可以這樣（指洩密）。
不過，媒體再追問，究竟是否有不配合就要走人的狀況？柯文哲語氣堅定的說，「我跟你說，再講一遍，這個人離開絕對不是因為這件事情，還有其他事」，但並未再多說，留下伏筆。
