總統府發言人陳以信30日晚間表示，中研院長翁啟惠上午已向馬英九總統提出書面辭呈，馬英九並未同意，已在辭呈上批示：「中研院為我國最高學術研究機關，其院長之進退，事關重大。請翁院長儘速回國向本人及立法院報告後再予處理，以維護中研院之聲譽，並避免外界誤解。」

翁啟惠因女兒翁郁琇持有浩鼎股票引發爭議，日前曾隔海發表聲明指出，女兒認購股票資金來源是「父母贈與」，對於造成社會大眾疑慮致歉，並表示盡快回國赴立院說明，立法院教育文化委員會31日下午也已排定議程，邀請翁啟惠報告業務概況。

但據立院教育委員會備詢的教委會召委、國民黨立委陳學聖表示，中研院聯絡人告訴他，翁啟惠在美國生病住院中，醫生不讓翁啟惠出院，所以沒辦法到立法院報告並備詢。陳學聖說，既然如此，未來還是會繼續排中研院的業務報告案，只要翁啟惠還是中研院院長，就一定要來立法院報告，「排到他來為止。」31日的備詢則由中研院副院長王汎森代為出席。