針對台南市長賴清德日前在台南市議會備詢時表態「我當然主張台灣獨立」，前總統李登輝2日下午接受電台節目專訪前受訪時說，他沒有什麼意見，他不曾說過台灣要獨立，「台灣已經獨立了」。
國民黨台南市議員王家貞9月30日在市議會總質詢時，質疑台南市長賴清德的兩岸政策及立場，要求賴清德清楚表態；賴清德答詢時，則清楚表明他的台獨立場，他說：「我當然主張台灣獨立，並沒有主張一定要兵戎相向，中國要尊重台灣人民主張，台灣是主權獨立的國家。」
對於賴清德表態台灣獨立的說法，李登輝下午接受廣播節目《綠逗共和國》專訪前受訪時表示，賴清德有他自己的主張，他沒意見，「看會通不會通，如何與大陸維持關係」。李說，如果台灣要獨立，中國說不定會派軍隊攻打台灣，「這要看他如何負責」。
