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微軟+台大醫院!武肺患者基因研究效率大幅提升40倍

新頭殼newtalk | 林冠妤 綜合報導
1345-05-19T08:18:56Z
面對現有研究環境在處理巨量資料的侷限性,微軟頃注-Azure-HPC-高速算力與技術團隊,進行軟體修正、測試與驗證,找出最佳雲端硬體規格進行基因插補與分析。   圖:取自台灣微軟官網
面對現有研究環境在處理巨量資料的侷限性,微軟頃注-Azure-HPC-高速算力與技術團隊,進行軟體修正、測試與驗證,找出最佳雲端硬體規格進行基因插補與分析。   圖:取自台灣微軟官網

武漢肺炎至今仍然嚴峻,相關產業積極的尋找有效遏止的方法,或是研發疫苗,現在更是要從基因的角度找出真正的主因,而台大醫院與微軟合作,參與AI for Health計畫,試圖運用資料庫大規模的訓算,實質推動基因研發進展,透過微軟的Azure HPC技術,將運算速度提升了40倍,更是成功讓台大醫院突破運算瓶頸。

台灣微軟和台大醫院合作,參與AI for Health計畫,由全球最大的基因資料庫英國Bio Bank,提供50萬筆的人體生物樣本資料,而微軟頃注Azure HPC高速算力與技術團隊,更協助R程式套件的國外創辦者與Intel技術合作,共同進行演算法的修正與優化,讓整體效率大幅提升40倍以上運算,也成功地讓基因研究有所進展。

由於武漢肺炎有很多非典型的案例,如患有慢性病的長者,雖得到武漢肺炎,但卻在短期內痊癒,或是不具有慢性病病史的年輕人,得病後卻很快地去世,因此希望找到關鍵基因並建立風險評分機制,即可防範未然,預知罹患疾病的風險。

由於每個人的基因皆是世上獨一無二的組成,透過基因檢測可讓人們充分了解先天體質,預防疾病,而目前數據中每人會有大約73萬個比較常見的基因變異位點,在基因採檢時常有部分基因位點缺漏的狀況發生,因此醫療團隊在透過AI分析基因前,都需要花費至少數個月的時間,以機器學習方式預測遺失位點,補齊所有基因資料。

然而台大醫院現有的傳統伺服器在運行數個月後仍停留於插補程序運算,遲遲無法進展至分析階段,因此去年九月開始與微軟Azure專業技術團隊合作。微軟全球黑帶專家-亞洲區 HPC/AI 解決方案副總經理馮立偉表示,微軟提供Azure HPC 高速算力與技術團隊,並協助R程式套件的國外創辦者與 Intel 技術合作,也透過Azure HPC 提升基因運算速度 40 倍以上,大幅節省分析時間。

原需耗費數個月的1萬8千名武漢肺炎患者基因資料插補與分析,成功縮短至僅僅5小時,雙方團隊更將原需要計算超過二年以上的50萬筆基因,提前至四週內完成分析,下一步更預計將基因庫內每筆人體生物樣本近億個基因位點資料運算完畢,成為未來精準醫療的基礎。

台大醫院智慧醫療中心副主任李建璋表示,此次參與微軟AI for Health專案,接軌全球運算資源與技術專家,讓台大醫院不僅成功突破運算瓶頸,推進基因研究邁向新的里程碑。

武漢肺炎至今仍然嚴峻,相關產業積極的尋找有效遏止的方法,

台灣微軟和台大醫院合作,參與AI for Health計畫,

由於武漢肺炎有很多非典型的案例,如患有慢性病的長者,

台大醫院智慧醫療中心副主任李建璋。   圖:取自台灣微軟官網
台大醫院智慧醫療中心副主任李建璋。   圖:取自台灣微軟官網
台大醫院參與微軟全球-AI-for-Health-計畫,運用-Azure-HPC-在全球最大基因資料庫進行運算,大幅提升-40-倍以上運算效率。   圖:取自台灣微軟官網
台大醫院參與微軟全球-AI-for-Health-計畫,運用-Azure-HPC-在全球最大基因資料庫進行運算,大幅提升-40-倍以上運算效率。   圖:取自台灣微軟官網
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