蘇迪勒颱風造成自來水水質渾濁，台北市長柯文哲直轟是中央水土保持沒做好，新北市長朱立倫也將烏來災情歸責於上游崩塌，要林務局說明清楚。對此，農委會主委陳保基13日回應，南勢溪上游的東札孔溪經強降雨，下游水質仍清澈，顯示復育有成果，非水質混濁主因。他認為，混濁主因是在道路崩塌。
台北市、新北市都認為這次颱風災情與中央水土保持沒做好有關，甚至直指南勢溪上游的東札孔溪崩塌，正是造成水質混濁的原因。陳保基中午再次重申，林務局對南勢溪上游的東札孔溪崩塌已有完整說明，這次北市自來水混濁的情況，他個人認為，每次颱風不管北中南，包括石門水庫，也常有混濁的情況，主要是溪流，包含道路，在強降雨下都常有崩塌，「道路在河川兩旁的崩塌就是造成溪水混濁的原因，幾乎每年風災都有類似狀況」。
他說明，東札孔溪是30年前就有的崩塌地，在林務局的處理下，崩塌面積已在逐漸縮小當中，從空照圖來看，東札孔溪一直到南勢溪還有28公里，崩塌地下流的水都很清澈，因為它已崩成岩盤，所以雖然有強降雨，水並不那麼混濁。
陳保基也指出，但在東札孔溪到南勢溪這28公里間的道路，一直到南勢溪的取水口，這些都是原因，「光是烏來那些下來就不得了」，並駁斥中央水土保持沒做好，「我們水土保持的證據昨天就講得很清楚了」。
林務局長李桃生表示，東札孔溪的崩塌地在早年就形成，經過專家討論，因當地太陡，接近80度，人力機具無法到達，所以採自然復育的工作，也定期在河道清理，這次颱風從最新的空照圖來看，當地的降雨量在12小時達到632毫米，24小時722毫米，短時間強降雨創了歷史新高，而上游東札孔溪的崩塌地反而是縮小的，可見復育有達到成效，且崩塌應已到達一個段落，所以東札孔溪應該不是南勢溪水混濁的主因。
至於主因為何，李桃生說，主因是科學問題，所以必須各方來整治，看看是什麼問題，這是整個集水區各方面的水利、水保整治問題，所以林務局也跟相關機關有進行流域協調會報，相信經濟部主導的這個會議會詳細檢視這個過程，做更精密的科學判斷。他強調，「我要很負責任的講，東札孔溪從航照看起來，3年的比對，它在強降雨沖刷下，崩塌情況還沒擴大，代表自然復育有成功」，撇清台北市政府指責的水土保持問題。
