12月10日世界人權日前夕，新台灣國策智庫今(8)日邀請專家學者，針對馬英九總統自傲的人權政績進行總體檢，結果顯示馬政府執政下的司法人權，和民進黨執政時期相比是大幅倒退，甚至跟中國落後司法人權水準越趨同步。其他在政治 人權、經濟人權和社會文教人權等方面，馬政府的表現也讓專家學者不滿。
祟右技術學院財經法律系助理教授羅承宗表示，2009年3月底立法院通過兩公約後，人權議題在馬政府的施政藍圖下，即佔有重要地位。由副總統蕭萬長主持的總統府人權諮詢委員會則要等到2012年，亦即明年2月才會提出自身的人權報告。眾所週知，馬政府以兩公約施行法的制定及成立總統府人權諮詢委員會自豪，因此，新台灣國策智庫今天的報告書就是對馬英九執政3年來的人權政績進行鳥瞰確認。
首先就政治人權而言，在馬英九執政的3年內發生新聞自由在自由之家(Freedom House)總評比排名逐年下滑、中華電信以沒有足夠頻寬提供服務為由，拒絕與新唐人亞太台續約、新聞局插手公共電視人事、海協會秘書長陳雲林來台時，警方對抗議民眾鎮壓逮捕以及最近監察院對民進黨「好意提醒」於造勢場合拿小孩的小豬撲滿做政治獻金有違法之嫌、公投審議委員會否決公投提案、中選會倉促決定合併大選於１月14日舉行，犧牲首投族等。
至於司法人權部份，和民進黨執政時期相比，更是大幅倒退，從政治性羈押氾濫如陳明文案、蘇治芬案，及扁案的審理法官臨陣更換且偵查大公開（在起訴書未出爐前，邱毅手上已握有詳細資料）。還有江國慶案中，陳肇敏等不起訴的司法包庇、限制上訴權的《刑事妥速審判法》、只有50分的《法官法》、大法官提名鬧劇等。
而攸關人民生計的經濟社會人權，馬政府的表現同樣不及格，在其執政下，台北市的房價不斷升高、貧富差距不斷擴大、失敗的消費券政策，還有經濟大幅傾中，讓台灣的經濟命脈幾乎全部繫於對岸政府的善意，還有633政見的跳票等。
在社會人權方面，首先是行政院長吳敦義稱讚無薪假的發明可以得到諾貝爾獎；中科三期「違法不停工」、核四的持續興建及88風災的救災不力等。
最後，在文化人權方面，一言以蔽之，馬政府把文化變成中國國民黨的競選文宣，引發藝文界的批評。
嘉義大學公共行政研究所教授許志雄指出，馬政府執政下人權迅速倒退的原因有3個本質上的問題，第1個是中國國民黨的體質，因為國民黨在威權時期長期執政，所以幾乎沒有任何人權觀念。第2個，馬政府的黨政高官幾乎大部分都是在威權體制下培養出來的。負責執行人權政策的公務員體系在過去的養成環境中，普遍都沒有正確的人權觀念，這是長久威權體制下的結果。許志雄以自己過去擔任行政院人權保障推動小組副召集人的經驗表示，公部門對自己所掌管的法律或命令是否有違憲法人權並不自覺。例如集會遊行法採許可制即是。第3是國家定位的問題，因為國家定位和主權有關，也跟人權息息相關。國民黨死抱「一個中國」的觀念，長期讓台灣社會處在緊急體制下。
台北大學公共行政學系教授陳耀祥表示，馬政府上台以後發生一個現象，就是威權復辟，這個威權和過去的威權不同，是軟性威權，而「威權的土壤是長不出民主的果實」。台灣在1987年解除戒嚴，1991年終止動員戡亂後，最重要的工作就是轉型正義，也就是去威權化。然而民進黨執政時期，由於「朝小野大」之故，很多和轉型正義有關的法律無法通過，所以轉型正義尚未全部完成。另外，台灣現在雖享有民主化的成果，但很多台灣人對充滿威權思想的中國並沒有警覺，例如馬政府上台後，發生了陳雲林來台，國旗被沒收事件，即可得知台灣在主權的倒退及人權的倒退。
另外，陳耀祥也補充，網路的言論自由在馬政府時期大幅倒退。例如教育部行文台大的計算機中心，要台大管好PTT的網路言論即是鮮明的例子。
