台北馬偕醫院今（21）日下午發出新聞稿聲明，強調從來沒有拒絕陳水扁的戒護外醫轉診，院方強調，整件事從頭到尾，都沒有接獲台北監獄諮詢有關陳水扁就醫的相關問題，為北監指「台大、馬偕拒接扁」的說法狠狠打了一巴掌。
台北監獄副典獄長蘇清俊上午親自在北榮召開記者會，北監也以書面新聞稿指出，北監是在跟台大、馬偕等幾家醫學中心接觸皆碰了釘子後，才決定將扁轉診北榮，北監宣稱馬偕醫院「另有其他高階醫療人員向北監表示，基於場所較為擁擠及其他病人權益，希望不以該院為考量」，而且該院的功能性核磁共振檢查「僅供研究使用，臨床經驗尚有不足」，所以最後才拍板，讓北榮接手。
但稍晚馬偕醫院則發布新聞稿指出，截至目前為止，馬偕並無接獲北監諮詢有關陳水扁就醫的相關問題，北監根本就沒來問過，因此無所謂醫療高層或管理階層對於此事有不同意見之說。而且馬偕醫院還說，各大醫學中心都有功能性核磁共振檢查（Funtional MRI）儀器，多數都用在學術研究上，較少應用在一般臨床的治療用途，不明白北監的發言從何而來。
馬偕醫院表示，包括法務部及扁的醫療小組，先前都曾向該醫院詢問過相關意見，當時，馬偕醫院即已組成醫療團隊並規畫住院相關事宜，做為準備，何況身為醫學中心本來就不能拒絕病人的轉診，更何況馬偕醫院基於耶穌基督愛人如己、關懷弱勢的精神，對於任何有醫療需求者，均竭盡所能提供完善的醫療服務與照顧，不可能拒絕扁轉診。
