中油林園第4輕油廠副領班曹慶發開設長昱公司，專門替電鍍、螺絲工廠等處理強酸廢水，檢警單位接獲線報，查出長昱確實以暗管將廢污排入阿公店溪，旋即帶回曹慶發等6人訊問，其中陳姓等5名員工均坦承犯行，並指證受曹慶發指使所為，檢方分別以10萬至30萬元不等交保，曹慶發則裁定80萬元交保。
高雄市環保局則依廢棄物清理法依法查辦，並勒令停工，也將計算業者不法利得從重裁罰。
市府環保局長陳金德說，業者利用每天傍晚入夜後，在倉庫內以槽車載運廢酸到九孔橋，並在橋旁的倉庫內透過暗管排放廢酸進阿公店溪，平均每天約有3車次，且其酸度幾乎是純鹽酸的濃度。
雄檢今年6月接獲高雄市環保局通報阿公店溪屢遭染紅，即指揮環保單位及警方成立專案小組沿阿公店溪清查，發現九孔橋下箱涵洞內有2支不明管線，且有排放廢水痕跡，經採集廢液檢測驚見偷排廢液PH值小於1，屬強酸性廢水。
檢方旋即指派專員在附近埋伏，28日見長昱公司槽車又載廢水前來，持搜票搜索，採樣人員穿沼澤衣在九孔橋箱涵洞內採樣時，其中一支私設的暗管還意外爆裂，強酸液大量流出，現場滿地白色泡沫，冒起陣陣白煙。
檢方查出曹慶發在九孔橋下搭建鐵皮屋，鐵皮屋內放置加壓馬達，槽車將廢酸水載到鐵皮屋時，在屋內連結馬達水管，通由暗管排入阿公店溪，腐蝕性強酸因此染紅阿公店溪，9年來不法所得達3000至4000萬元。
檢方連夜趕往位於燕巢區的長昱公司，以及涉案人高雄市岡山區、楠梓區住處等處所搜索，帶回曹慶發等6人訊問，其中長昱公司陳姓等5名員工均坦承犯行，檢方諭令交保，而曹慶發因涉嫌違反廢棄物清理法第46條、第41條任意棄置有害事業廢棄物等犯罪嫌疑重大，且有串證及湮滅證據之虞，高雄地院法官則認為，曹慶發已坦承犯行，無羈押必要，裁定80萬元交保。
