康芮颱風帶來的豪大雨，讓嘉義、台南等地今(29)日紛紛傳出淹水災情，目前這2個縣市均已宣布停班停課，嘉義並封閉了多條道路與橋樑，呼籲民眾儘量不要外出。至於台南市府則宣布，今天若有因雨積水造成學生上學、上班遲到者，要求校方及企業不要列入紀錄。
目前已宣布今天下午停班課的縣市包括：雲林縣、嘉義縣市、台南市、高雄市、宜蘭縣和花蓮縣。另外，屏東下午停課不停班。
康芮颱風夾帶旺盛西南氣流滯留於南部，瞬間即時雨量非常大，據嘉義氣象站指出，嘉義縣大林鎮中坑從今天凌晨0時至上午8時15分，雨量高達422毫米，遠超出「24小時降雨350毫米以上」的超大豪雨標準，高居全台降雨排行榜首位。
康芮颱風也造成台南市仁德區三爺溪、港尾溝溪溪水暴漲，尤其是新營區、新化區淹水嚴重，市府已在清晨啟動預防性疏散撤離，包含安養院、保全戶已完全疏散撤離完畢，目前沒有人員傷亡。其中，新化知義里新和庄近20戶透天厝約在清晨5時多開始淹水，水淹一層樓高，消防局緊急調派特搜小組和多個消防分隊前往用救生艇幫助民眾脫困。
台南市府同時動員警力，管制道路積水、土石滑落路段，而且做必須性封路、封橋，台南市府上午11點也宣布下午、晚上均停班課；而今天上午除了關廟區國中、國小停課外，仍正常上班上課者，若有因雨積水造成學生上學、上班遲到者，市府要求不列紀錄。
此外，高雄從凌晨開始也陷入狂風暴雨中，市區街道多處積水，有些地方甚至水深及膝，許多騎士穿梭在積水路段，非常驚險，還有人孔蓋冒出大量雨水，造成低漥地區陸續淹水，所幸目前尚未傳出重大災情。
總統府發言人李佳霏表示，馬英九總統相當關心各地雨量狀況，提醒大眾不要輕忽雨勢可能帶來的災情，也希望大家注意自身安全，做好防護措施。
對淹水災情，馬英九表示，從莫拉克颱風之後，大家可以看到真正的可怕之處不是風，而是雨；不是風災，而是水災。這讓大家學到一個教訓，千萬不要忽略大雨可能造成的問題，希望大家不要掉以輕心。
