對於總統府在11月14日資公布20位資政名單包括：親民黨主席宋楚瑜、中研院前院長李遠哲、獨派大老史明、獨派辜寬敏、台積電創辦人張忠謀等，彭明敏28日發出聲明表示，感謝總統的盛意，但表達難以接受的理由而予以婉謝。
彭明敏幕僚表示，在總統府公佈資政名單時，彭明敏即告訴總統府，年事已高，恐無法勝任此重要職務，沒有接受蔡英文總統的聘任。不過，彭明敏同意給總統府2個星期時間處理他的聘任事宜；但過了2週，看到總統府還是維持此一聘任，因此，才會在28日發出此聲明。
以下為彭明敏11月14日致函總統府婉謝之聲明：「總統府今日公布資政名單，本人亦列名其中。數月前，蔡總統曾經邀請出任總統府資政，本人已表達因年事高，體力有限，深居簡出，恐無法勝任此重要職務。總統盛情邀請，衷心感激，謹請原諒再次婉謝。 2016年11月14日」
對此，總統府發言人黃重諺表示，蔡英文除了表示理解與尊重，並再次感謝彭明敏教授長久以來為台灣民主所做出的貢獻，也祝福彭明敏身體康健，平安順心。對於彭明敏表示曾於先前婉拒而仍獲任，經了解，應為幕僚連繫過程中，訊息傳遞誤差，致相關作業未及完備，也特此向彭明敏表示歉意。
