前總統馬英九被控訴5年前處理當時立法院長王金平、立委柯建銘等人所涉司法關說案時，將特偵組仍在偵辦中的案情告知時任閣揆江宜樺等人，因此涉犯洩密等罪嫌。一審時以馬當時行使《憲法》賦予總統的「權限爭議處理權」、可阻卻違法為由，判無罪，之後檢方上訴高院二審。不過今（15）日，卻逆轉判馬4月徒刑，可以易科罰金，可上訴。
高院在審理前檢查總漲黃世銘違反通訊保障及監察法時，發現前總統馬英九有違法之虞，北檢進行調查後認定馬為撤銷王金平黨籍、拔除他立法院長的資格，依涉刑法中，公務員洩漏中華民國國防以外秘密罪嫌、通訊保障以及監察法和個人資料保護法起訴。不過在台北地院進行一審時，認為馬是在行使「權限爭議處理權」而判無罪，今天高院於二審宣判，依通保法判4個月徒刑，可易科罰金。
王金平等人所涉及的司法關說案，源於最高檢察署特偵組（已被修法廢除），於2013年間，偵辦另案監聽時發現，柯建銘所涉及的全民電通更一審，當時被判無罪，柯涉請王金平向當時法務部長曾勇夫、高檢署檢察長陳守煌關說，後該案柯建銘因未檢方不上訴，而確定無罪。
針對馬撤銷王黨籍和喪失立法院長職位一事，北檢認為，馬明知總統、行政院長無從指揮監督檢察官，且檢察總長也沒有向行政院長報告偵查中的刑案義務，卻打電話給黃世銘，要他向江宜樺報告，江因而得知偵查秘密、通訊資料以及柯建銘的個資。
本案一審時，台北地院由法官唐玥獨任審理，她認為馬英九的行為構成洩漏國防以外秘密、使用通訊監察所得秘密和利用個人資料，但依據憲法第44條「總統對於院與院間之爭執，除本憲法有規定者外，得召集有關各院院長會商解決之。」為專屬總統的權限爭議處理權，得構成阻卻違法是由，因此獲判無罪。
對此，檢方上訴高院，認為一審區解《憲法》，因當時並無發生院際爭執，馬英九僅找襲正院長商議，頂多是「人際調解」，並不能算是「院際調解」，且馬名知當時關說案尚未偵結，不應洩漏案情給非偵辦人員。
而柯建銘也認為本案一審「遇到恐龍法官」，更批馬違憲亂政，「假借關說案之名，行政治鬥爭之實」，與院際調解權無關，目的是在於對王金平的「政治追殺」。
不過，馬對於檢方的起訴與上訴，表示「都是區解、構陷、恐嚇，完全無視總統的責任與權力」，反問檢方難道「要總統明知有人集體關說司法時，禁止討論、思考，只能置若罔聞，或若無其事，然後回家睡大覺？」
馬英九的辯護律師團認為，馬基於總統職責，針對司法關說案及將引起輿論的政治風暴，預先跟行政院長討論，是「處理國家大政的依法作為」，司法應該予以尊重，對檢方表示「難道元首治理國家的決策，都得先經過檢察官的核准同意？」
馬指出現任總統蔡英文去年召開司改國是會議，因為「總統是憲政慣例的實踐者及創造者」，也是行使「院際調解權」的做法， 馬還當庭強調「我沒有違背誓言，我沒有忘記責任，我沒有濫用權力，我沒有犯罪。」
