農業部專案進口雞蛋被外界檢視，遭質疑圖利特定廠商，近日又因台農蛋品標錯進口雞蛋效期，引發食安疑慮，風波持續延燒，農業部長陳吉仲19日請辭獲准。對此，民眾黨總統參選人柯文哲直言，陳吉仲自豪進口雞蛋「政府用5.7億創造60億效益」，現在各縣市政府查核的成本、食品廠被掃到的颱風尾，人民連雞蛋都不敢放心吃。全民浪費的成本、效益「又要怎麼算？」
柯文哲在臉書發文寫道：「談雞蛋，看食安。農業部進口的雞蛋引發食安疑慮，台北、台中、桃園市紛紛向中央索討進口蛋流向，卻沒下文。中央畜產會被發現存放過期的巴西蛋5309箱，待報廢銷毀；桃園市則查獲有業者把143萬多顆進口蛋改成散裝籃蛋賣給路邊店、早餐店，還未標示產地，也有加工成未殺菌液蛋還打上『台灣』。」
柯文哲提到，之前農業部大動作用臉書反擊「說我指控不實」，陳吉仲19日在記者會的說明「卻沒有辦法解釋任何一件事」。他指出：「我很早就提醒農業部，雞蛋是生活必須品，首先要注意的就是『食安問題』。農業部卻說巴西雞蛋期限有90、110、120天的，噴蠟後像手機包膜、汽車打蠟，可以延長期限3個月到半年，把雞蛋跟手機類比，真讓人無言。」
柯文哲續指：「再來，農業部說效期是按照出口國來源場標示，給國內洗選場時也有附上效期，結果被加工業者踢爆，畜產會便宜行事，送來的進口雞蛋上『有類似蝌蚪文的非英語國家文字』，導致誤標。效期沒有規範、放生下游業者冷鏈斷鏈，導致標示不實、流向不清、還推給蛋商背黑鍋，地方政府得自立自強當偵探」。
柯文哲並表示：「人民眼睜睜看著農業部和衛福部互踢皮球，連累所有使用雞蛋的店家。現在雞蛋不搶購了，因為大家不敢吃。陳吉仲自豪進口雞蛋『政府用5.7億創造60億效益』，現在各縣市政府查核的成本、食品廠被掃到的颱風尾，人民連雞蛋都不敢放心吃。請問陳吉仲部長，全民浪費的成本、效益，又要怎麼算？」
