中央流行疫情指揮中心統計，國內目前累計有15例兒童重症個案、5例死亡，其中重症個案包含7例併發腦炎，對此ACIP召集人李秉穎今早在廣播節目中表示，由於過去沒有新冠病毒流行的經驗，因此還不知道兒童確診後導致猛爆性腦炎詳細過程，只知道可能會引起神經併發症，而這與1998年感染腸病毒71型的臨床表現有點像，都是直接影響到腦幹。

李秉穎今接受資深媒體人周玉蔻的廣播節目《新聞放鞭炮》訪問時說明，兒童染疫後併發腦炎的臨床表現有點類似像腸病毒71型這類病毒，某些兒童因為體質關係，感染腸病毒71型後病毒會跑到腦幹，影響生命中樞，引起肺水腫、急性心臟衰竭，大多1、2天就會死亡。而新冠病毒根據國外經驗，也會影響腦幹，台灣個案也有類似情況，感染後一下子非常猛爆，不一定能夠救的回來。

李秉穎說明，新冠病毒與腸病毒有類似地方，可能因病毒感染呼吸道，病毒在某些人體內，經過臉部神經直接連到腦幹，產生很大威脅。因此提醒家長，如果小朋友只要出現任何不正常症狀，包括肌曜型抽搐、意識昏迷，一定要盡快送醫。