近來陸續有議員質疑台北通App的個資安全問題，無黨籍台北市議員林亮君更批台北通已成暴吃市民個資的怪獸。台北市發言人陳智菡今（17日）痛批，一直看到有人質疑北市藉由台北通蒐集、竊取個資、綁架台北市民，還帶風向說北市是吃個資的巨獸。她強調 :「這些不明就裡、似是而非的言論，正在一點一點抹煞市府同仁們長年累月來的努力、想汙名化北市府、更阻擋城市數位轉型的腳步」。
陳智菡於臉書發文指出，為避免各位市民朋友被誤導，她要嚴正澄清，台北通是北市府開發的整合式服務APP，註冊時採實名認證，希望協助市民在台北市活動更方便；所以不管是愛心卡、愛心陪伴卡、敬老卡、學生證、兒童優惠卡、借書證、中低收入戶證明等18種卡證，都整合在同一APP裡，不用帶著厚厚一疊卡出門，只要帶手機就好；「這不叫綁架、這叫數位便民」。
陳智菡說，台北通像一個入口、一個快速通道，通過之後大部分資訊「不會留在台北通」，例如：防疫實聯制掃完，資訊會存在雲端28天，只有防疫需要才會由衛生單位調閱，過期了就自動銷毀；其他福利身分（例如65歲以上長者、學生、低收入戶等的個資）原本就存在各業務單位（敬老卡資料在社會局、借書證原本就在圖書館），根本不在台北通。
她直言，台北通介接其它服務或系統時，個資使用非常嚴謹，例如由介接中央1922疫苗預約系統，就要再次取得民眾個資授權同意書才能介接到中央，絕不會有無限授權的問題。北市為了保護個資還設立北市政府資料治理委員會設置要點、成立資料治理委員會，「北市是要用大數據輔助市政，這是進步e化的世界趨勢，市府要應用大數據也得經過委員會的討論、有會議要點、一定有會議記錄、把資訊都去識別化才可以使用」。
陳智菡強調，這幾天，很遺憾的，看到許多議員在還不了解的狀況下，竟胡亂指控，還有人在臉書跟公開社團散布台北通連動個人健康檢查的資料、指控北市府意圖監控人民……，用極端聳度的不實指控來恐嚇民眾。她沉痛指出，這些不明就裡、似是而非的言論，正在一點一點抹煞市府同仁們長年累月來的努力、想汙名化北市府、更阻擋城市數位轉型的腳步。
陳智菡表示，北市府在做的，是希望協助整合資訊、更e化便民、促進轉型並減少浪費，這幾個月來北市致力推廣用台北通掃實聯制就是明證，該系統讓國家不需要支付大量的簡訊費用，節省上千萬公帑，大量減緩中央簡訊實聯制預算的壓力，而且所有個資都受到嚴格的保護、不可能挪為他用。
