立法院於107年三讀修正《農田水利會組織通則》，預告農田水利會將改制為公務機關，停止辦理會長及會務委員選舉，會長任期屆滿後，將由政府指派。立院國民黨團認為有違憲疑義，聲請釋憲，大法官認為本案與《司法院大法官審理案件法》要件不符，故不受理。
民國107年1月17日，立法院三讀修正通過《農田水利會組織通則》，農田水利會將於今年10月1日起，改制為公務機關，停止辦理會長及會務委員選舉，會長任期屆滿後，將由政府指派。農委會的「農田水利處」則更名為「農田水利署」，升級為三級機關，全台17個水利會將改制為17個分署，分別設置農田水利事業作業基金，並搭配子法管理水利會相關資產。
中國國民黨立法院黨團認為，《農田水利會組織通則》第40條牴觸憲法「主權在民」之民主原則，也侵害憲法第14條「保障集會結社自由權」、第15條「財產權」及第23條「比例原則」，向大法官聲請釋憲。
大法官解釋，立法委員現有總額三分之一以上聲請解釋憲法，須就其行使職權，適用憲法發生疑義，或適用法律發生有牴觸憲法之疑義者，始得為之。本件聲請人並未敘明行使何種職權，適用該規定發生有何牴觸憲法之疑義，與《司法院大法官審理案件法》要件未合。
立法院為國家最高立法機關，有議決法律制定案或修正案的專屬職權。立法委員基於維護憲政秩序及法治原則職責，於制定或修正法律時，應自行審定符合憲法意旨的條文。
如果法律公布施行經相當時日，立委認為有違憲疑義，自應先行提出修正案，並於確定修法未成後，由少數之三分之一以上立法委員聲請解釋。
大法官指出，相關規定於107年1月31日修正公布，聲請人若確信規定有違憲疑義，應先行使其憲法所賦予的修法權限未果後聲請釋憲，但未見法律修正案提出。另外，行政院同年3月27日曾函請立法院審議「《農田水利會組織通則》第19條之2及第38條之1條文修正草案」，但仍未議決。
大法官認為，本件聲請案與《司法院大法官審理案件法》第5條第1項第3款規定不合，決議不受理。
