台北市議會長達3週的市政總質詢在12日傍晚落幕，由於11日質詢時，柯文哲當場訓斥北捷總經理孫以濬，引發外界熱議。柯文哲最後在結語時特別提到，他知道自己不給人留情面，也知道那不對，「我會慢慢把我的腦袋換成適合當台北市長的人。」呼籲市府團隊與議員一起努力，讓台北市越來越好。
議長吳碧珠首先總結，指這次質詢共觸及299個市政問題，不管是承諾辦理、編列預算或者專案報告，都希望能即刻進行。其中，以MERS防疫要刻不容緩，校園安全、食安保障以及治安整頓等，也都是即刻要做。
吳碧珠特別提醒柯文哲學會帶人帶心，議員代表不同民意，應平起平坐、相互尊重；也應該好好對待部屬官員，不喜歡他用奇怪、粗暴的言語，傷人自尊，沒有餘地。她強調，柯文哲以後要「三思、三思、再三思，尊重、尊重、再尊重。」
柯文哲隨後也發表結語，他說，自己的態度就是「別人有批評，我們聽一聽，有道理，就去做。」市議員一直提供給他很多資料，也矯正一些執政方向。他認為，台北市議會總質詢應該是6都中最和諧的，言語衝突較少，態度對事不對人，這是台灣政治新的里程碑。
關於議員質詢重點的大巨蛋、松山文創、三創等案，他強調，政治是延續的，以前留下的問題，「作為一個醫生，我們沒辦法拒絕病人。」他也希望，能儘快為相關問題建立制度，面對問題是解決問題第一步，也許過程中感覺有很多衝突，但是，社會不要害怕衝突，要有解決衝突的機制，這個城市才會越來越好。
柯文哲說，自己過去生活經歷相當偏狹，也知道自己態度不給人留情面，原因是他當過17年台大外科加護病房主任，以前在台大醫院罵更兇，他知道那不對，但是，醫院裡每一個錯誤就要死一個人，所以自己對錯誤的容忍度很低。
柯文哲強調，他認為，換了位置，本來就應該換腦袋，「我會慢慢把我的腦袋換成適合當台北市長的人。」他說，有些行為他會回去檢討，等新的文化建立後，很多東西可以更smooth（圓滑）。「我相信台北市會越來越好，那大家就一起努力吧！」
