根據媒體報導，目前正參加博鰲論壇的前副總統蕭萬長6日和中國前國務院副總理曾培炎會面時，表達兩岸可攜手開發疫苗的意見，對此，台聯黨團今（8）日表示，疫苗是維護我國人民健康的戰略物資，不該當成商業利益的交換工具，馬政府不要把「連戰換成蕭萬長」，卻只「換湯不換藥」，繼續施行連戰為了商業利益，犧牲台灣利益的兩岸戰略。

兩岸共同市場基金會董事長詹火生6日轉述，蕭萬長和曾培炎會談時，主動關心、詢問中國的禽流感疫情，蕭萬長還以我國國光生技生產的疫苗為例，指出我國疫苗獲得美國、聯合國認證，如透過中國提供原料，兩岸可攜手合作開發疫苗。

不過，對於此番言論，台聯黨團認為不妥。台聯黨團指出，疫苗是維護台灣國民建康的戰略物資，不能當成商業利益的交換工具，而且在Sars和幾次流感在中國爆發的經驗，證明中國政府刻意隱瞞疫情導致病毒產生變異，疫情擴大，兩岸合作疫苗，將使新疫苗面對變異病毒，而無用武之地的風險。

此外，台聯黨團指出，目前中國仍有2千顆導彈對著台灣，許多新病毒都被懷疑是中國生化實驗室生產出來的，如兩岸合作開發疫苗，將使中國掌握台灣疫苗的基因排列及成份，進而發展台灣無疫苗抵禦的病毒生化武器。