高等教育評鑑中心近日公佈的「2010世界大學科研論文質量評比」中，台灣各校顯得欲振乏力，而中國學校排名卻大幅度進步。評鑑中心研究員黃慕萱觀察，中國科研論文在既有論文數量勝過台灣的基礎上，科研論文的「質」也正急起直追，台灣學校要保有兩岸三地排名之首，唯有持續追求質優的論文一途。
高等教育評鑑中心自2007年開始進行評鑑工作，今年公佈的排名中，台灣大學再度蟬聯兩岸三地第一，排名114名，表現超越中國大陸與香港的學校；其次為成功大學302名、清華大學346名、交通大學479名和長庚大學493名。
台灣大學的評比成績不甚理想，黃慕萱在「開放編輯室」節目上表示，台灣論文數仍維持穩定地成長，但中國大陸急起直追地速度卻超乎想像，今年台大仍能站上兩岸三地學校排名第一名，一方面是論文勝過中國的「質」，一方面論文數又超過香港。
但現今香港也在衝量，中國也在衝質，黃慕萱懷疑台灣的優勢還能維持多久。她觀察，中國的經濟支持下，中國大學在科研論文排名，可能短期1或2年內就能超越台灣頂尖的台灣大學，台灣要想保持領先地位，量已經不太可能再上升，唯有在質的部份能跟中國一較長短。
如把全職教師數納入考量後，量少質精的學校往往在「參考排名」上都有不錯成績，而新加坡、中國、香港的學校反而會比較落後。黃慕萱指出，學校規模會造成評比影響，雖然學校規模也是一種競爭實力，但以台灣大學為例，教師數不超過2000名，學校規模顯然無法突顯研究型大學的特色，因此列出考量全職教師數的條件下，台灣的大學都有不錯成績，顯示台灣學校能在稀少的資源下，做出不錯的成績。
黃慕萱指出，世界知名的英國高等教育調查機構QS、泰晤士報的評比主觀意識較重，同裁評比在前者佔有50％，而後者也佔有33％，只要是採用同裁評比的部份，中國北大與清華的排名都會超越台大，而上海交大強調學術非凡成就，因此做出一份客觀合乎事實的評比是台灣高等教育評鑑的特色。
