被視為扁系人馬的陳哲男一家，面對楊秋興的參選，發生不同調的情況，陳哲男任職於高縣府的女兒陳書芸表示將隨楊秋興退黨、陳哲男也透過她表示支持楊秋興；陳哲男的兒子陳其邁昨天則發出聲明，表達支持陳菊之意。陳水扁在今(11)日下午亦透過扁辦同表支持陳菊的態度。這不同的表態，讓人聯想到扁政府時代陳菊與陳哲男家的宿怨。
高雄縣長楊秋興在正式宣布退黨參選參選大高雄市長後，家住在高雄市的民進黨中執委陳其邁發出聲明表示支持陳菊的態度，隨後即出國而去，但他仍社群網站臉書(Facebook)上這樣寫著：「歷史評價不會反映在你的最後職位是什麼，而是你曾經堅持過什麼？」陳其邁在公開信中表示，「對於楊秋興先生在初選公正落幕後卻執意脫黨參選，本人難以認同。」
擔任高雄縣政府文化局長的陳書芸，今天上午在縣議會受訪時則重申，她認同楊秋興支持文化、藝術的態度，所以願意退出民進黨，和縣長同進退。
陳哲男則是在昨天下午透過陳書芸表達支持楊秋興參選的態度。他說，民進黨初選過程確有失公平，向黨中央多次反應均未處理，偏袒意味很濃厚；他認為既然如此，楊秋興沒必要遵守遊戲規則，應支持他走自己的路。
面對楊秋興的參選，扁系人馬陳哲男一家子不同調，陳水扁今天下午透過辦公室聲明：「有人要離開民進黨的家，我卻回不了家！」他同時稱楊秋興是「民進黨不可多得的政治領袖」，但他認為，打政績牌未必是選舉投票的唯一考慮，贏的策略與關鍵在「格局」的不同，所以陳菊勝出。陳水扁強調，「棄黃昭順保楊秋興」的狀況是不可能存在的。陳水扁要楊秋興多珍惜，重新思考有無必要離開民進黨這個家。
在2005年8月，陳菊當時擔任扁政府勞委會主委，她接受媒體訪問時，針對高雄捷運工程外勞弊案，脫口一句「有力人士」，引起很大風暴，至於誰是「有力人士」？當時陳菊並沒有透露。但媒體開始把矛頭指向陳哲男，也讓陳哲男身陷政治風暴，請辭總統府副祕書長一職、當時擔任高雄市副市長的陳其邁也請辭，不過，司法最終判陳哲男無罪定讞。
或許因為這段過去的恩怨，即使陳水扁表態力挺陳菊，陳哲男仍然堅定支持楊秋興。但是對位居黨內決策核心的陳其邁而言，他與父親的政治選擇，顯然是大不同；兄妹各自延續自己的政治生命，都必須做出最切合現實的選擇。
