台大校長當選人管中閔遭檢舉從2005在中研院任職，疑赴大陸兼職，涉及違法。教育部國際司長畢祖安指出，現任專任教職人員都不得赴大陸兼職，但如果是短期到大陸演講，則尊重學術自由。
畢祖安表示，根據教育部在98年解釋函「現行與大陸地區公立學校交流政策，關於『研究、教學人員交流』部分僅限於一般交流常態的短期客座講學，請勿涉及聘任我方人員擔任教職或研究職務事宜。」
而除了專任教職人員不得赴大陸兼職外，包括各級學校若要與大陸地區學校締結聯盟，也得依據「兩岸人民關係條例33-3」呈報教育部核定，而「校與校」之間的交流，也要不能涉及聘任我方人員擔任教職或研究職務事宜。
對於管中閔在大陸大學兼職一事，台大與教育部今天都無具體回應，台大檢舉教師表示，管中閔教授在2009年以後，在臺大任職，2012至2015年擔任政務官，2015年2月卸任後，依照相關法令必須「管制三年」，這三年期間管中閔有沒有偷跑？也需要查明。
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