高鐵工會及高鐵公司於21日晚間達成協議，因此，春節期間，高鐵將正常行駛。對此，行政院發言人孫立群22日表示，政府對於台灣高鐵工會及公司能在勞資雙方秉持善意與理性溝通原則下達成協議，攜手同心全力完成春節疏運，表示肯定與感謝。
由於積欠加班費爭議，高鐵工會帶頭要求公司回應員工需求，由於高鐵公司要求等行政訴訟結果出爐後，再決定要不要把加班費補足，因而引發工會不滿，揚言要在春節期間「依法休假」。在政府的協調下，雙方終於達成協議，高鐵公司同意先將一半的加班費以「激勵獎金」名義發給員工，若行政訴訟判定公司違法，就再補足另一半費用；若未違法，則當成獎金，不再要回；另外，公司也同意工會的要求，將補助人力，以避免員工持續血汗的情況。
對此，孫立群指出，副院長張善政關切社會大眾公共運輸服務之權益，21日上午即請政委許俊逸召集交通部與勞動部瞭解高鐵勞資糾紛事件之原委，並要求交通部以勞資和諧、避免影響春節疏運為最高指導原則，同時，也指示勞動部介入協調，務必使全案圓滿調處。
孫立群表示，張善政要求交通部督請高鐵公司妥處，提出最大善意與工會溝通，使工會了解公司照顧員工權益的誠意，同時希望工會成員了解公共運輸假期正常疏運是大家共同的責任；請勞動部協助建立雙方協商平台，積極調解，盡最大努力避免影響春節疏運。
同時，張善政也指示，交通部及高鐵局未來仍需持續關注台灣高鐵勞資雙方議題，並提供必要協助。在這次高鐵勞資溝通過程中，交通部及勞動部跨部門合作努力協調台灣高鐵工會及公司面對面溝通，並促成雙方達成協議，充分發揮政府一體功能。
另外，工會理事長黃昱凱下午指出，工會的訴求一切依《勞基法》，高鐵公司也承諾，將來國定假日上班，都要依法給加班費。由於交通部長陳建宇曾說，高鐵員工為權益罷工違反天職，黃昱凱則反駁，鐵道業的天職不應該建立在違法的事件上。
高鐵工會則感謝帶領抗爭的黃昱凱，以及聲援的各團體、民眾，工會表示，不能說是搏倒大鯨魚，但黃昱凱真實的帶領一群小蝦米，以團結一致的心對抗大鯨魚，爭取依法該還給同仁的正義。工會更強調，這是第一仗，但不是最後一仗。
