頂新集團爆發油品混用大統黑心油長達6年，日前又被爆料進口棉籽，頂新網頁也被發現曾標明該公司曾用機器「壓榨出棉籽油」，因此遭疑可能壓榨棉籽油，但流向不明。農委會主委陳保基今(6)日表示，經過調查，初步認為頂新並無製造棉籽油，棉籽則是作為飼料及有機肥使用。
頂新網頁標明，該公司所生產的棉籽粕有機肥料，是由國外進口棉籽，由頂新進口的脫棉機脫棉後，再用機器壓榨出棉籽油。不過，目前的網頁上已增加公司聲明，說明該批生產機具已於民國80年報廢，目前進口的棉籽只壓製成棉籽粕作為有機肥，並無取油。
針對國民黨立委李慶華質詢，網頁可能是頂新榨油證明，陳保基表示，他也是第一次看見這個網頁，但經過查驗，頂新擁有4張有機肥登記證，過去3年進口926噸棉籽，223噸販售給下游廠商作為乳牛飼料，其餘則做成有機肥料。他指出，頂新棉籽進口及銷售的量相符，中間只有4%的差異，應是壓製棉籽粕過程間的耗損。
陳保基說，農委會5日已前往市面取樣，抽取頂新販售的有機肥，檢測其含油量，再回推棉籽原本的含油量，若合乎比例，就能證明沒有壓榨。他還說，目前的調查中，初步並無發現頂新曾製造棉籽油。
不過，陳保基指出，進口棉籽1公斤僅8-10元，比黃豆便宜很多，而進口棉籽粕的價格則差不多。廠商為何選擇進口棉籽而非棉籽粕，仍有疑慮。
另外，台聯立委許忠信質疑，頂新彰化廠為製油廠卻沒發現煉油設備；陳保基則回應，頂新僅進口約千噸棉籽，「油都被機器吃掉了，煉不出什麼油」。他補充，棉籽只供做反芻動物飼料，對於增加乳牛泌乳則有幫助。
民進黨立委陳亭妃認為，棉籽直接壓成棉籽粕作為乳牛飼料，內含的有毒物質棉酚並未處理，人體飲用後是否會有影響。對此，陳保基保證，絕對沒有問題。
