台南鐵路地下化與新台南車站日前正式啟用，卻在首日爆出廁所淹水、電梯與手扶梯故障停用等問題，民進黨立委林俊憲今（20日）於立法院質詢相關議題，並呼籲在穿堂設置座椅供民眾休息。交通部長陳世凱回應，。總體來說，第一天的問題他們確實有看到，並全部做了改善；至於座位的問題，真的需要好好討論。
新台南車站啟用首日，站內設施後卻有多處異常，從旅客反映廁所排水不良導致地板淹水，到第二月台發生手扶梯、電梯停用，手扶梯上方出現滴水現象，再到月台顯示班次資訊錯誤，旅客卻在月台找不到站務人員確認班次等問題，甚至在網路引起討論。
陳世凱說明，關於第一天會有粉塵問題，他在16日有去看切換軌道的過程，因為外面的道碴
移動，整個軌道的隧道口粉塵相當重，當火車進出的高氣壓進來，粉塵就會多；目前已做改善，讓地下軌道的通風口好一點，粉塵會漸漸降低，現在民眾已經沒有感受到什麼粉塵。
至於排水問題及電梯問題。陳世凱解釋，不曉得為什麼會有民眾把廁所廢水管塞毛巾、布料等，以至於汙水管整個爆出來，目前已經改善；而手扶梯方面，可能民眾還不太習慣，不曉得觸碰到按鈕，目前已有做宣告。
林俊憲再提到，新車站的穿堂非常大，卻完全沒有半張椅子讓人坐著休息，對長輩或行動不便者非常不方便，這要馬上來改善。陳世凱坦言，這個後續他們要來討論一下，因為現在大家是快速經過，未來有些人等車會喜歡待在穿堂層，有沒有座位真的需要好好討論，他會請他們趕快來討論，可以用一區來做成休息區。