中國近日公布「宗教教職人員網絡行為規範」，將台灣宗教教職人員納入規範，規範提及，宗教教職人員在傳播訊息時，不得含有煽動顛覆國家政權、反對中國共產黨領導、破壞社會主義制度、國家統一等內容。對此，美國聖湯瑪斯大學國際研究講座教授葉耀元直言，台灣若再不跟中國切清楚，哪天中國可能會宣稱納管台灣所有公務體系跟民間團體也說不定。

針對中國片面聲稱要納管台灣宗教教職人員，葉耀元18日在臉書發文表示，說真的，台灣如果再不跟中國政府切清楚，哪天中國可能會宣稱納管台灣所有公務體系、民間團體也說不定。但要跟中國切清楚，需要民眾的支持，他真心希望台灣人不要再相信中國假意的溫柔，或想要去吃下糖衣包裝的毒藥。

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葉耀元指出，跟中國切乾淨（一邊一國，兩岸彼此無瓜葛）並不是獨派人士的台獨，只是講清楚什麼是現狀而已。當然從中國的角度來說，台灣的現狀其實就是台獨，不管台獨華獨什麼獨，只要不跟中國統一在一起都是台獨。

內政部嚴正駁斥，台灣是自由民主國家，中國粗暴將台灣宗教教職人員納入規範，已嚴重侵犯台灣宗教自由及人身安全。陸委會強調，中國對台灣不具管轄權，批中共片面地、粗暴地將台灣宗教教職人員納入規範，企圖形塑對台長臂管轄假象，這對台灣人民沒有約束力，更凸顯中國公然地將政治與統戰黑手介入宗教信仰。