截至今年9月止中央自購5351萬劑各品牌疫苗中，約有350萬劑，有約6.5％疫苗須過期報銷，總計共約12億元，引發外界質疑。對此，指揮中心指揮官王必勝表示，為提供足夠疫苗需超前部署，但無法精準，當然會產生屆效問題。

指揮中心統計目前約有350萬劑疫苗須過期報銷，而高端疫苗報銷為所有品牌之冠，約為5億元，遭外界質疑浪費納稅錢。對此，王必勝表示，絕對不是要浪費，是要提供足夠疫苗，但無法精準，且很多國家都有這類問題。

王必勝指出，大家強調超前部署，當然會產生屆效問題。而為了要讓民眾有選擇，因此施打疫苗種類很多，購買量當然會比較多一點。在施打意願上，知道疫情比較緩和的時候，疫苗施打率就會比較差。另還有新疫苗開發，以次世代疫苗開發來說，對相關期程沒辦法完全掌控，世界各國在發展疫苗，有了就買新的，這也都會造成屆效問題。