國安局長陳明通日前被爆曾於7月初以公費前往泰國湄公河旅遊，國民黨立委李德維、民眾黨立委蔡壁如都質疑，彼時身陷前新竹市長林智堅論文風波的陳明通，是去「避風頭」的。國安局旋即回應，相關內容非屬事實，而國安局人員有關活動，則一向不對外說明。對此，美國聖湯瑪斯大學國際研究講座教授今（13）日於臉書發文感嘆，台灣最大的問題不是中共，而是內部來亂的，「大家到底知不知道國安局是在幹嘛的？」
葉耀元說明，國安局隸屬於國家安全會議，而國家安全會議直屬於總統，所以稱國安局為總統旗下的核心情報單位也不為過。基本上，幾乎所有的當代國家都有類似的組織，因為任何國家的主要任務，就是去確保該國家不會因為內憂外敵而被侵略或消失。是此，我國國安局主要負責三大任務，綜理國家安全情報、特種勤務策劃執行、統籌密碼管制研發。
葉耀元表示，簡單來說，國安局的工作除了保護現任與卸任正副總統之外，就是在資安與情報上面進行統整，並透過整理出來的資訊跟其他相關單位進行協調與調度，確保台灣不會因為「不可預測」的事情，而出現國家安全意外。說起來很簡單，做起來難如登天。他指出，目前在網路上到處飛的假訊息，國安局要去掌握；民間傳遞的小道消息，國安局要去掌握；國外發生的大小事，國安局要去掌握；中共內部的派系鬥爭跟習近平最近又在搞什麼事，國安局要去掌握。這些都只是日常作業，而遇到突發事件，他們手上所需要處理的訊息量就會瞬間爆炸。
葉耀元補充，除了整合資訊之外，國安局也需要自己蒐集資訊。除此之外，國安局對於這些訊息的判定與評估，必須要具備足夠的專業知識才有辦法減低誤判。而且這些項目因為其敏感性，基本上都不會公開。所以要去追蹤國安局局長，到底是為了什麼事情去泰國訪問（有沒有去也不知道），就如同國安局的聲明稿所述，「本局人員有關活動，一向不對外說明」。
他認為，如果抓著這個國安資訊不公開的原則，把陳明通的行程與林智堅的論文案全部扯在一起，某種程度就是去扯國安局的後腿，也就是扯台灣安全的後腿。「這就跟你去問裴洛西訪問台灣的時候，蔡英文總統在閉門會議裡面到底跟裴洛西談了甚麼事情是一樣的道理。媒體當然可以大做文章，說蔡英文總統可能因為政治因素而說了什麼？但這種臆測不僅僅會傷害國家對外的形象，更會破壞一般民眾對政府的信任。」
葉耀元提到，媒體會這樣報導，就代表有一定的受眾，這是很簡單的供需法則。但是針對國家安全議題也用一樣的套路在處理，這除了是要刺激內患，藉此獲得選票的支持之外，也想不到其他的理路了。他說，「至少在美國，我頂多看到美國國家安全局局長或中央情報局局長的公開發言受到媒體的批判，但美國這些『超級自由』的媒體，也不會沒事去質疑這些單位對國家的忠誠，或是把他們的行為都跟政治計算掛上邊。」
葉耀元強調，合理的質疑當然有其道理，但在情報不足的前提之下，搞了一堆政治假設然後大做猜疑，講白了大可不必，「除非你覺得國家安全議題不重要，可以當做茶餘飯後的八卦來處理」。
