自從前年8月24日上任高雄市長，陳其邁即擔任高雄疫情中心指揮官，憑藉本身公衛的專長，帶領高雄市安然度過幾波疫情，成為市民健康的守護者，在各媒體的民調中，防疫往往成為最受肯定的一環，滿意度近九成，尤其一些領先全國的做法，更是直接打中市民的心坎，「暖男市長」果然不是浪得虛名。
Covid-19疫情始於2020年初，對民眾的生活發生了翻天覆地的影響，全國從上到下，萬事莫如防疫急，高雄市的防疫工作直到陳其邁贏得市長補選後，才開始步上正軌，「緊緊緊」市府團隊秉持｢以民為本｣的服務理念，全心投入防疫工作。
陳其邁不辭辛勞，每天召開防疫會議，加強各局處橫向聯繫分工合作，每日也召開專家會議，由專家提供防疫專業建言並納入高雄市防疫政策執行。各局處、行政區首長也站上第一線成為現場指揮官，並將民眾意見反饋到每次會議，適時滾動式調整改善防疫措施。
市府團隊除配合中央防疫政策，一發現確診個案，即以最快的速度透過警察單位協力，將電子足跡結合簡訊實聯制，運用科技加速完成精準疫調、擴大匡列及隔離，並提早進行醫療整備，專責病房加上原有的負壓隔離床及四大醫學中心、市立醫院，隨時可清空2541床，並做分級分艙分流的規劃，確保確診者於24小時內獲得醫療關懷。
在防疫作戰中，Covid-19疫苗接種是關鍵環節，陳其邁考量高齡長者面臨數位落差，市府透過民政系統分發通知單，並依照行政區規劃分時分流接種，並引進日本「宇美町」式施打法，採醫護移動、長者不動的方式，縮短長者走動時間，提升接種速度，讓高雄的接種率一直高於全國的平均數據。
陳其邁將心比心，落實一連串讓長輩感到貼心的措施，其中一些還是全台首創。為體諒75歲以上獨居、身心障礙或行動不便長者，只需聯絡當地區公所，即可安排計程車到府接送，將長輩載往指定地點接種疫苗，車資由市府補貼。 除了提升長者疫苗接種意願及施打效率，也改善疫情期間計程車司機的收入。
另外，高雄市也提供孕婦專診、臥床個案到宅接種服務。後續持續依據中央流行指揮中心Covid-19疫苗接種計畫，視疫苗配賦劑量，逐步規劃完成各類族群疫苗接種作業，以提升全市疫苗涵蓋率，保障市民健康。
「關懷包得來速」的規劃，構想來自速食店先點餐、再取餐的得來速車道。無論確診者、居家隔離者都適用，接獲確診簡訊2個小時後，就可以請親友或同住家人代為到所在行政區的「關懷包得來速」領取，平均只要一分半就領得到，可說非常方便。
高雄有海港與空港，邊境防疫的成功為台灣守住了南方的國門，但隨著國際陸續鬆綁邊境管制，考量國內外疫情與醫療量能，並兼顧促進經濟及社會活動與國際交流之必要，中央流行疫情指揮中心在一定人數總量控管下，將逐步放寬邊境檢疫措施。
現階段Covid-19疫情已逐漸進入社區化，目前國內疫情雖然持平穩定，但社區陸續出現Omicron變異株BA.4/BA.5個案，再加上邊境政策逐漸開放，社區感染風險提升，陳其邁提醒市民仍應確實遵守相關防疫規定。
眼見疫情已進入與病毒共存的時期，高雄市將繼續配合中央防疫政策秉持「正常生活、積極防疫、穩健開放」的原則，視疫情發展滾動式調整防疫措施並加強宣導，持續辦理各項疫情防治及紓困振興業務，提升社會整體經濟效能、社區安全。
