四大公投案18日全數闖關失敗後，民進黨政府乘勝追擊，民進黨團總召柯建銘、新竹市長林智堅力推新竹縣市合併，蔡英文總統19日召集高層會商，府院黨高層就新竹縣市合併案達成共識，但前總統陳水扁21日表態不認同這做法，他表示，台灣已經有6個直轄市，中國那麼大也才4個，新竹再升格就太誇張了。他強調：「小台灣不要變大中國」。
陳水扁接受「震傳媒」節目專訪時提到，台灣那麼小、中國那麼大，但台灣已經有6個直轄市，如果新竹再升格「豈不是比中國大陸還大？」陳水扁坦言，當初讓北高兩市升格，就是為了讓國民黨選不贏做的決定，他呼籲政府參考當時的例子，不應重蹈覆徹。
陳水扁也指出新竹合併升格的缺點，他提醒：「公務人員都得加一級、加薪，直轄市資源固然比較多，身為行政首長，預算不要白不要，這都是人性。」若真的決定升格新竹，陳水扁建議乾脆國土重劃，他直指台灣六都已經太多，若再加一「未來宜蘭、花蓮、台東、苗栗、基隆怎麼交代？澎湖、金門、馬祖呢？」
陳水扁認為，以後勢必還會有七、八、九都，不如國土重劃，讓大家當「都長」，否則其他縣市居民會變成二、三等，甚至不入等的公民。不過，雖然不支持新竹獨立升格，但陳水扁也說：「如果全盤整體規畫，我就贊成。」他補充：「一次解決，不要差別待遇。」柯建銘則回應，近期會前往陳水扁廣播節目「有夢上水」擔任嘉賓，屆時會跟他好好溝通。
