國產高端疫苗未獲國際認證，中央流行疫情指揮中心已宣布，若施打高端民眾要出國，需在混打其它國際疫苗。台北市長柯文哲也在臉書砲轟，「民進黨政府不要讓國產疫苗變成笑話，不要把信賴你的人民，當作為政府解套的工具人。」對此，行政院長蘇貞昌今（16日）於立法院受訪稱，台灣因為疫情穩定，可供試驗的病例很少。
面對高端疫苗未認可為世界衛生組織（WHO）的緊急使用清單。柯文哲昨於台北市議會接受備詢期間，稱這是早就知道的事，早在一年前他就預測一定是這樣，沒辦法。柯文哲事後更在臉書發文批評，身為一個醫生，他認為指揮中心的說法完全不負責任，請問當國際上六月份就開放多種疫苗混打，指揮中心為何拖到現在？是不是在為高端護航？ 請問有沒有臨床試驗、專家會議 可以證明混打高端可以產生更高效價的中和抗體？有沒有重打間隔的安全評估報告？
柯文哲更稱，如果都沒有，就請大大方方的承認這 不是「混打」而是「重打」。不是因為高端量不夠不得不然、而是人民因為信賴政府政策卻被限制了人身自由，不得不再挨兩針，未來要是因此產生不良反應，請中央政府像高端沒過三期試驗就下單一樣 爽快買單。
蘇貞昌則回應，口罩跟疫苗都是重要的戰略物資，台灣是世界上極少數能自己生產疫苗的國家，但因為疫情穩定，可供試驗的病例很少。
蘇貞昌也承諾，國產疫苗有得到WHO的補助，已經可以到第三國去進行第三期的實驗 ，政府對於整體疫苗的產製，跟進入整個各國要接受都必須經過的程序了解，也會儘量協助國人同胞。
