台北市長柯文哲過去多次呼籲中央推行「疫苗護照（疫苗通行證）」，他還預告將以台北通做為疫苗通行證，9日更提透露，不需要中央同意介接問題，只要用戶同意，找任何醫院都可以接健保署資料庫。然而對於疫苗通行證是否納入中國科興、國藥疫苗？柯文哲主張，台灣應遵守國際規則，用WHO（世界衛生組織）的標準為準。
無黨籍台北市議員陳建銘9日於台北市議會市政總質詢時表示，柯文哲過去有提到北市疫苗通行證將上線，而現在碰到年關將近，很多台商要從中國返台，回來前接種了科興、國藥疫苗，能否接受這些台商持相關證件做疫苗登記？柯文哲回覆，這是衛福部長陳時中應該回答的問題，每次都說要參加WHO，但WHO認證的卻不承認。
陳建銘指出，柯文哲應督促陳時中，或是表現出不同的意見，這些台商很多都是台北市民，打過WHO認證的科興、國藥疫苗，結果回台灣走到哪裡都處處受限。針對台北疫苗通行證是否納入WHO認證的科興、國藥疫苗？柯文哲坦言：「我認為應該是可以啦！但我不曉得國家法令。」
柯文哲接著表明：「我覺得還是用WHO的標準為準啦！我是主張用WHO標準。」而陳建銘強調，台灣可以不買科興、國藥，但民眾已經打了這些疫苗，且還通過國際認證，所以希望柯文哲能積極保障台北市民權益，別讓市民權益受到傷害、被政治污染。柯文哲則承諾「可以。」
