國立清華大學校友會被爆與中國廈門市政府、北京清華大學在清華大學校內的育成大樓共設「清華海峽研究院」，且未經許可在清大校內設立「清華海峽研究院新竹辦公室」，從事技術研發、攬才、投資等業務，外界質疑中共組織滲透進清大。提供出租的自強工業科學基金會今（8）天發聲明指出，有鑒於租用單位適法疑慮，將於15日提前中止與該單位的租約。

自強基金會董事長盧崑瑞表示，據他所知，清華海峽研究院因為疫情的關係，已有相當長一段時間未運作。但因為遭外界質疑，加上租用單位有適法疑慮，基金會將會在11月15日提前中止與該單位的租約。

對此，清華大學表示，清華海峽研究院是部分校友成立的服務校友的推廣教育及創業機構，且僅向自強基金會轉租清大校內空間作辦公室；並指出，此機構不屬於清大，校方未曾知悉或參與其中的業務運作。

另外，據悉，清大退休教授蕭德瑛曾任清華海峽研究院執行長，但多年前已辭去職務，目前也未擔任該會任何職務。