疫情指揮中心公布截至7月9日各縣市疫苗配送及接種人數統計，其中嘉義縣從公布以來剩餘量就偏高。對此，嘉義縣衛生局長趙紋華解釋，因登錄系統是依據醫療院所在地區分，才導致接種人次產生大量誤差。
趙紋華表示，嘉義縣請台中榮總嘉義分院協助施打疫苗，但中央衛福部登錄系統卻是以醫療機構所在地區分，才致使位於嘉義市的台中榮總嘉義分院上傳資料後，有部分嘉義縣疫苗接種人數會納入嘉義市疫苗接種人數。
截至7月9日為止，嘉義縣總共獲配發大約8萬9000劑疫苗，但剩餘量有3萬7000劑，剩餘率達41%。嘉義縣衛生局表示，嘉義縣於7月10日就已經施打了6萬8000劑疫苗，使用率達76.9%，與中央所公布的數字有很大落差。
嘉義縣衛生局表示，針對疫苗施打人數誤差情形已經向衛福部反映，建議修正相關數據，避免嘉義縣努力提高疫苗施打率，但未能呈現真實成果。
